基于蛋白质组学方法揭示SERPINB9在复发和难治性多发性骨髓瘤中的参与

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD022182

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

多发性骨髓瘤（MM）是一种常见的血液系统恶性肿瘤，其复发和再发机制尚不明确。值得注意的是，硼替佐米耐药导致的复发使MM治疗面临重大挑战。为阐明耐药机制，我们采用定量蛋白质组学方法，鉴定与硼替佐米耐药复发和再发性MM（RRMM）相关的差异表达候选蛋白。我们使用串联质谱标签-质谱（TMT-MS）技术，将5例新诊断MM（NDMM）患者的骨髓活检标本与5例诊断为硼替佐米耐药RRMM患者的标本进行比较。通过基因本体论（GO）、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路和层次聚类分析，确定差异表达蛋白的亚细胞定位和功能分类。利用11例NDMM和8例RRMM患者的组织样本，通过平行反应监测（PRM）分析对鉴定出的主要候选蛋白进行验证，随后与包含10例MM患者和10例健康对照的NCBI基因表达综合数据库（GEO）数据集（登录号：GSE80608）进行比较。

通过TMT-MS技术，在RRMM中鉴定出34种差异表达蛋白，其中包括蛋白酶抑制剂9（SERPINB9）。随后对鉴定出的候选蛋白进行的功能富集分析表明，它们参与调节RRMM中的细胞代谢、凋亡、程序性细胞死亡、淋巴细胞介导的免疫及防御反应途径。通过PRM分析以及与NCBI GEO数据集的比较，确认了首要候选蛋白SERPINB9。我们阐明了硼替佐米耐药RRMM的蛋白质组图谱，并将SERPINB9确定为一个有前景的新型治疗靶点。我们的结果为未来RRMM机制研究提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。