DMD、BMD与WT猪骨骼肌蛋白质组分析

主题标签:骨骼肌、蛋白质组、DMD、BMD、WT猪、肌肉骨骼系统疾病。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。本数据集为肌肉骨骼系统疾病领域公开数据集,主题涵盖骨骼肌。

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蛋白质分类骨骼肌蛋白质组DMDBMDWT猪肌肉骨骼系统疾病
Proteome analysis of skeletal muscle of DMD, BMD and WT pigs

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

DMD、BMD与WT猪骨骼肌蛋白质组分析

该数据集英文名为“Proteome analysis of skeletal muscle of DMD, BMD and WT pigs”,聚焦于骨骼肌的蛋白质组分析,涉及杜氏肌营养不良(DMD)、贝克尔肌营养不良(BMD)以及野生型(WT)猪三类研究对象。从主题标签来看,数据集涵盖骨骼肌、蛋白质组、DMD、BMD、WT猪及肌肉骨骼系统疾病等关键词,属于肌肉骨骼系统疾病领域的公开数据集。该数据集来源于ebi.ac.uk,原始描述将其标注为Jan Bernd Stöckl发布的蛋白质组分析数据集,并提供PRIDE归档项目编号PXD064879作为访问入口。整体而言,该数据集围绕肌营养不良相关猪模型的骨骼肌蛋白质组展开,为肌肉骨骼系统疾病研究提供公开可获取的数据资源。

【数据集背景】

该数据集面向肌肉骨骼系统疾病研究,核心关注点是骨骼肌的蛋白质组。DMD(杜氏肌营养不良)与BMD(贝克尔肌营养不良)均属于肌营养不良相关疾病,数据集将这两种疾病模型与野生型(WT)猪并列纳入分析,构成疾病组与对照组的比较框架。数据集的主题标签明确包含“骨骼肌”“蛋白质组”“DMD”“BMD”“WT猪”“肌肉骨骼系统疾病”,说明其设计意图在于通过蛋白质组层面的分析,考察疾病状态与野生型状态之间在骨骼肌中的差异。数据集在来源站被归类于肌肉骨骼系统疾病领域,属于该领域的公开数据集资源。

【数据内容】

该数据集的内容为骨骼肌的蛋白质组分析数据,研究对象包括DMD、BMD和WT猪三类。主题标签表明数据涉及骨骼肌组织与蛋白质组两个核心维度,并覆盖DMD、BMD与WT三种分组。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数量、定量指标、差异表达结果等详细数据内容,源站未提供。数据集名称本身表明其分析对象为骨骼肌,分析层次为蛋白质组,分组依据为DMD、BMD与WT三种类型。

【采集与来源】

该数据集来源于ebi.ac.uk,源站描述中给出的引用信息为Jan Bernd Stöckl的“Proteome analysis of skeletal muscle of DMD, BMD and WT pigs [Dataset]”,并附有PRIDE归档项目链接https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD064879。数据集英文名称为“Proteome analysis of skeletal muscle of DMD, BMD and WT pigs”。关于样本采集的具体流程、实验方法、仪器平台、数据处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肌肉骨骼系统疾病领域的公开研究使用,尤其适合围绕骨骼肌蛋白质组开展的分析工作。由于数据集同时包含DMD、BMD与WT猪三类对象,可用于疾病模型与野生型之间的蛋白质组比较研究,也可用于肌营养不良相关机制探索中的候选蛋白筛选与验证参考。数据集的主题标签涵盖骨骼肌与蛋白质组,因此也适合作为骨骼肌蛋白质组学研究的公开数据资源。关于更具体的适用场景说明,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过源站提供的PRIDE归档项目入口访问,项目编号为PXD064879,链接为https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD064879。使用者可依据该入口获取数据集相关内容。关于数据文件的具体格式、下载方式、分析工具建议及使用步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集,来源于ebi.ac.uk,并具有明确的PRIDE项目编号。关于数据质量评估指标、样本量、技术重复、数据完整性及已知偏差等信息,源站未提供。使用者在利用该数据集时应结合自身研究目的进行判断。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参考源站描述中给出的引用信息:Jan Bernd Stöckl, Proteome analysis of skeletal muscle of DMD, BMD and WT pigs [Dataset], https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD064879。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD064879

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Jan Bernd Stöckl, Proteome analysis of skeletal muscle of DMD, BMD and WT pigs [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD064879

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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