PRJNA596656:轻链淀粉样变性测序

通过对高度纯化的骨髓克隆浆细胞进行全外显子测序,研究轻链淀粉样变性患者的免疫遗传学景观。主题标签:轻链淀粉样变性、全外显子测序、骨髓克隆浆细胞、免疫遗传学、肌肉骨骼系统疾病

ena
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时间序列分类轻链淀粉样变性全外显子测序骨髓克隆浆细胞免疫遗传学肌肉骨骼系统疾病
PRJNA596656: Light chain amyloidosis sequencing

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

PRJNA596656:轻链淀粉样变性测序

PRJNA596656 是一个围绕轻链淀粉样变性展开的测序研究数据集,英文名称为 Light chain amyloidosis sequencing,在站内归入肌肉骨骼系统疾病下的其他类别,来源站为 ebi.ac.uk。该数据集的核心工作是对高度纯化的骨髓克隆浆细胞进行全外显子测序,以此考察轻链淀粉样变性患者的免疫遗传学景观。轻链淀粉样变性属于浆细胞异常增殖相关疾病,异常克隆浆细胞产生的轻链蛋白沉积于组织器官并可造成损害,骨髓中的克隆浆细胞因此成为研究该病分子与免疫遗传背景的重要材料。该数据集以全外显子测序为技术手段,聚焦骨髓克隆浆细胞的遗传变异信息,主题涵盖轻链淀粉样变性、全外显子测序、骨髓克隆浆细胞与免疫遗传学,可为相关疾病的机制探索和后续研究提供数据基础。

【数据集背景】

轻链淀粉样变性是一种与克隆浆细胞相关的疾病,其发生发展与浆细胞异常产生的轻链蛋白密切相关。要理解患者的免疫遗传学特征,需要在细胞层面获取可靠的遗传信息。该数据集正是针对这一需求而建立,研究目标明确为刻画轻链淀粉样变性患者的免疫遗传学景观。研究选择高度纯化的骨髓克隆浆细胞作为分析对象,这一取材策略有助于将测序信号集中于克隆浆细胞本身,减少骨髓中其他细胞成分的干扰,从而更准确地反映与疾病相关的遗传改变。数据集来源站为 ebi.ac.uk,站内分类将其归入肌肉骨骼系统疾病下的其他类别。

【数据内容】

该数据集的内容围绕全外显子测序展开,测序对象为高度纯化的骨髓克隆浆细胞,研究主题包括轻链淀粉样变性、全外显子测序、骨髓克隆浆细胞和免疫遗传学。全外显子测序针对基因组中的外显子区域,可用于发现与蛋白质编码相关的遗传变异,结合高度纯化的克隆浆细胞样本,能够为研究患者的免疫遗传学景观提供序列层面的数据支撑。关于数据的具体样本数量、测序平台、数据量、文件格式与目录结构等信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ebi.ac.uk。研究对象为轻链淀粉样变性患者,采集材料为骨髓中的克隆浆细胞,并在测序前进行高度纯化处理,随后开展全外显子测序。该设计将样本取材、细胞纯化与外显子测序衔接起来,形成从患者骨髓克隆浆细胞到测序数据的采集流程。关于采集地点、采集时间、伦理审批信息以及具体的纯化方法,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于轻链淀粉样变性免疫遗传学背景的研究,例如考察患者克隆浆细胞中的外显子区域变异特征、探索与疾病相关的遗传改变,以及为浆细胞异常相关疾病的机制研究提供数据参考。由于数据聚焦于高度纯化的骨髓克隆浆细胞,也可用于需要将分析对象限定于克隆浆细胞群体的研究场景。关于该数据集在其他具体研究方向上的适用性,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可围绕全外显子测序数据开展变异检测、注释与免疫遗传学层面的分析,并结合样本来自轻链淀粉样变性患者、取材为高度纯化骨髓克隆浆细胞这一背景进行结果解读。关于数据下载方式、访问入口、分析流程与推荐工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集针对高度纯化的骨髓克隆浆细胞进行全外显子测序,样本纯化有助于提高克隆浆细胞来源信号的针对性。同时,全外显子测序主要覆盖外显子区域,对于非编码区域的信息获取存在范围上的局限。关于数据质量评估指标、覆盖度、样本量、批次信息及验证情况,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,英文名称为 PRJNA596656: Light chain amyloidosis sequencing。关于引用方式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA596656

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Study of immunogenetic landscape of light chain amyloidosis patients by whole-exome sequencing on highly-purified bone marrow clonal plasma cells.

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