PRJNA1473406：人骨骼肌中肌少症相关候选基因的转录组分析与多层优先级排序
该数据集来自 NCBI，包含人骨骼肌样本的原始测序数据，覆盖肌少症患者与非肌少症对照。项目通过 RNA 测序刻画肌少症相关转录组改变，并开展差异表达分析，结合独立公共骨骼肌转录组队列、与四肢瘦体重和握力相关的孟德尔随机化证据、蛋白互作网络分析及实验验证进行整合优先级排序，可用于研究肌少症骨骼肌分子变
基本信息
资源简介
PRJNA1473406：人骨骼肌中肌少症相关候选基因的转录组分析与多层优先级排序
PRJNA1473406 数据集来自 NCBI，主题为“人骨骼肌中肌少症相关候选基因的转录组刻画与多层优先级排序”。该数据集包含人骨骼肌样本的原始测序数据，样本覆盖肌少症患者与非肌少症对照。项目通过 RNA 测序刻画与肌少症相关的骨骼肌转录组改变，并在此基础上开展差异表达分析，识别肌少症相关基因；随后结合独立公共骨骼肌转录组队列、与四肢瘦体重和握力相关的孟德尔随机化证据、蛋白互作网络分析以及实验验证，对候选基因进行整合优先级排序。该数据集为研究肌少症骨骼肌的分子变化提供了转录组资源，并支持发现肌少症潜在生物标志物和治疗靶点。本站将其归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads）。
【数据集背景】
肌少症是一种与骨骼肌功能减退相关的疾病，其分子层面的改变尚未被充分阐明。该项目的目标是对人骨骼肌中与肌少症相关的转录组改变进行刻画，并识别可能参与肌少症相关肌肉功能障碍的候选基因。研究围绕肌少症患者与非肌少症对照的骨骼肌样本展开，试图从转录组层面寻找与疾病相关的基因表达变化，并通过多种证据的整合提高候选基因筛选的可靠性。这一背景决定了该数据集的核心价值在于为肌少症的分子机制研究、生物标志物发现和潜在治疗靶点探索提供原始测序数据与转录组资源。
【数据内容】
该数据集的内容为人骨骼肌样本的原始测序数据，属于原始测序读段类型。样本来自肌少症个体和非肌少症对照个体，覆盖病例与对照两类人群。基于这些测序数据，项目开展了差异表达分析，以识别肌少症相关基因。除原始测序读段外，源站描述还提到项目进行了整合优先级排序，所用证据包括独立公共骨骼肌转录组队列、与四肢瘦体重和握力相关的孟德尔随机化证据、蛋白互作网络分析以及实验验证。就数据内容的具体规模、样本数量、测序平台和读段长度等信息而言，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，标识为 PRJNA1473406。其样本类型为人骨骼肌样本，采集对象包括肌少症患者与非肌少症对照。项目通过 RNA 测序对上述样本进行转录组分析。关于样本采集的具体地点、时间、纳入排除标准、伦理审批信息以及测序服务的具体提供方，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究肌少症骨骼肌的分子变化，尤其是转录组层面的改变。研究者可以利用其中的原始测序数据开展差异表达分析，识别与肌少症相关的基因；也可以将其作为转录组资源，用于探索肌少症的潜在生物标志物和治疗靶点。项目所采用的整合优先级排序思路——结合独立公共骨骼肌转录组队列、与四肢瘦体重和握力相关的孟德尔随机化证据、蛋白互作网络分析及实验验证——可为候选基因的筛选和验证提供参考框架。此外，该数据集也可用于比较肌少症患者与非肌少症对照在骨骼肌转录组上的差异。关于该数据集是否适合其他特定分析用途，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以原始测序读段的形式提供，使用者可按原始测序数据的常规处理流程进行质量控制、比对和表达定量，进而开展差异表达分析。项目描述中提到的分析步骤包括差异表达分析、结合独立公共骨骼肌转录组队列的整合分析、与四肢瘦体重和握力相关的孟德尔随机化证据评估、蛋白互作网络分析以及实验验证。使用者可参考这些分析环节组织自己的研究流程。关于数据下载的具体方式、文件格式、是否提供预处理后的表达矩阵或分析代码，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 RNA 测序产生原始读段，并经过差异表达分析和多层证据整合。项目描述提到使用了独立公共骨骼肌转录组队列、孟德尔随机化证据、蛋白互作网络分析和实验验证，这些环节有助于提升候选基因筛选的稳健性。然而，关于测序深度、数据质量评估指标、批次效应处理、样本量大小以及验证实验的具体结果，源站未提供。使用者应注意，该数据集主要面向肌少症相关转录组研究，其结论的适用范围受研究设计和样本构成的限制；源站未提供关于数据质量与局限性的进一步说明。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，项目标识为 PRJNA1473406。关于数据引用方式、许可条款和使用限制，源站未提供。使用者在使用该数据集时，应遵循 NCBI 及相关数据提交方的规定，并建议查阅源站页面获取最新的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1473406
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目旨在表征与肌少症相关的人体骨骼肌转录组改变，并识别可能参与肌少症相关肌肉功能障碍的候选基因。对肌少症患者和非肌少症对照者的骨骼肌样本进行了RNA测序。通过差异表达分析识别肌少症相关基因，随后利用一个独立的公共骨骼肌转录组队列、与四肢瘦体重和握力相关的孟德尔随机化证据、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析以及实验验证进行整合优先级排序。该数据集为研究肌少症骨骼肌的分子变化提供了转录组资源，并支持识别肌少症的潜在生物标志物和治疗靶点。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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