基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

重度再生障碍性贫血患者外周血单个核细胞的单细胞转录组图谱

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA1467443，项目主题为重度再生障碍性贫血患者外周血单个核细胞的单细胞转录组图谱。其英文名称为“Single-cell transcriptomic profiling of peripheral blood mononuclear cells from patients with severe aplastic anemia”，源站标题为“ID 1467443 - BioProject - NCBI”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。本站将其归类为肌肉骨骼系统疾病 / 其他，主题标签为 Raw sequence reads。整体来看，该数据集围绕重度再生障碍性贫血这一疾病，以外周血单个核细胞为研究对象，通过单细胞转录组技术获取原始测序读段，为相关研究提供可追溯、可链接的项目级数据入口。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，项目编号为 PRJNA1467443。BioProject 是围绕某一项研究计划或计划集合而组织的生物数据集合，通常由单一机构或联合体发起。一个 BioProject 记录为用户提供统一入口，用于查找该项目所产生的多种数据类型及其相关链接。该项目的主题聚焦于重度再生障碍性贫血患者外周血单个核细胞的单细胞转录组图谱，属于单细胞转录组研究范畴。本站将其归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类，主题标签为 Raw sequence reads，表明该项目涉及原始序列读段类型的数据。

【数据内容】

该数据集的核心内容是重度再生障碍性贫血患者外周血单个核细胞的单细胞转录组图谱。其主题标签为 Raw sequence reads，说明项目包含原始测序读段。项目英文名称明确指向“单细胞转录组图谱”，研究对象为外周血单个核细胞，疾病背景为重度再生障碍性贫血。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读段长度、数据量、细胞数目、基因表达矩阵或分析结果等更具体的数据内容描述。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1467443 - BioProject - NCBI”。项目由 NCBI BioProject 数据库收录，项目编号为 PRJNA1467443。BioProject 记录通常由单一机构或联合体发起，并作为相关生物数据的统一入口。关于样本采集地点、采集时间、患者纳入标准、伦理审批信息、具体研究机构或研究者信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与重度再生障碍性贫血相关的单细胞转录组研究场景，尤其是针对外周血单个核细胞的转录组图谱分析。由于主题标签为 Raw sequence reads，该项目可用于需要原始测序读段的二次分析、数据挖掘或方法学验证等用途。其 BioProject 记录形式也便于用户通过统一入口查找与该项目相关的多种数据类型和链接。关于该数据集是否适用于特定临床诊断、疗效评估或与其他疾病数据集的整合分析，源站未提供明确说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 PRJNA1467443 或源站标题“ID 1467443 - BioProject - NCBI”进行检索和访问。BioProject 记录提供统一入口，用于查找该项目产生的多种数据类型及其相关链接。由于主题标签为 Raw sequence reads，用户可根据项目页面提供的链接进一步获取原始序列读段数据。关于具体下载方式、数据格式、分析流程、软件工具或参数设置，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集以 BioProject 记录形式呈现，提供项目级的数据组织与链接入口。其主题标签为 Raw sequence reads，表明数据可能以原始测序读段形式存在，后续分析需依赖用户自身的处理流程。关于数据质量、测序深度、覆盖度、批次效应、样本量、重复性、缺失值或技术偏差等信息，源站未提供。此外，该数据集仅涉及重度再生障碍性贫血患者外周血单个核细胞的单细胞转录组图谱，是否涵盖健康对照或其他疾病类型，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 PRJNA1467443，源站标题为“ID 1467443 - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制、版权归属或数据共享政策，源站未提供。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 数据库及该项目页面的相关说明，并遵循源站的一般使用条款。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1467443

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1467443

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

重型再生障碍性贫血（SAA）是一种危及生命的骨髓衰竭综合征，以全血细胞减少和骨髓增生低下为特征，主要由免疫介导的造血干细胞及祖细胞破坏所驱动。尽管既往研究已确立T细胞过度活化在SAA发病机制中的核心作用，但外周血免疫细胞在单细胞分辨率下的全面细胞与分子图谱仍未完全阐明。本研究对来自新诊断、未经治疗的重型再生障碍性贫血患者的外周血单个核细胞（PBMCs）进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq）。主要目标是剖析免疫细胞亚群的异质性，识别疾病相关的转录特征，并揭示可能促进免疫失调和无效造血的前所未见的细胞状态或细胞间通讯网络。外周血样本采集自符合既定诊断标准的SAA患者。PBMCs通过Ficoll密度梯度离心法分离。

单细胞文库使用10x Genomics Chromium平台制备。文库在Illumina NovaSeq 6000系统上测序，目标测序深度约为每个细胞50,000条reads。原始测序数据使用Cell Ranger处理以生成基因-条形码矩阵。质量控制、降维、聚类和差异基因表达分析使用Seurat进行。细胞类型基于经典标记基因进行注释。下游分析包括轨迹推断、细胞间配体-受体相互作用分析和基因集富集分析，以评估通路活性。该数据集提供了6名SAA患者和6名健康对照者循环免疫细胞的高分辨率图谱。这些数据将有助于理解疾病免疫病理学、识别潜在的b

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别