PRJNA1455686:人胎儿成骨细胞(hFOB)细胞系全基因组测序

该数据集为 NCBI BioProject 收录的人胎儿成骨细胞(hFOB)细胞系全基因组测序项目,编号 PRJNA1455686,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,本站归类于肌肉骨骼系统疾病/其他,主题标签为 Phenotype or Genotype

sra
浏览 12
基因组分类Phenotype or Genotype
PRJNA1455686: Whole genome sequencing of the human fetal osteoblast (hFOB) cell line

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1455686:人胎儿成骨细胞(hFOB)细胞系全基因组测序

PRJNA1455686 是 NCBI BioProject 收录的一项全基因组测序项目,研究对象为人胎儿成骨细胞(hFOB)细胞系。该项目以 BioProject 编号 PRJNA1455686 进行标识,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,本站将其归类于肌肉骨骼系统疾病/其他类别,主题标签为 Phenotype or Genotype。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录形式,通常来源于单一机构或联合体,并为用户提供统一入口,以查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集的核心内容即围绕 hFOB 细胞系的全基因组测序展开,属于表型或基因型相关主题,可为关注成骨细胞基因组特征的研究提供数据入口。

【数据集背景】

该数据集对应 NCBI BioProject 数据库中的一项记录,编号为 PRJNA1455686,标题为“Whole genome sequencing of the human fetal osteoblast (hFOB) cell line”。BioProject 作为生物数据组织框架,旨在将同一研究计划下产生的多种数据类型集中关联,便于用户从一个记录出发访问相关数据。该项目的来源机构或联合体信息、具体研究背景、项目目标等,源站未提供。本站将其归入肌肉骨骼系统疾病/其他分类,主题标签为 Phenotype or Genotype,说明该项目在分类上与肌肉骨骼系统疾病领域相关,并涉及表型或基因型主题。

【数据内容】

该项目为全基因组测序项目,研究对象为人胎儿成骨细胞(hFOB)细胞系。全基因组测序通常用于获取细胞或生物体基因组的序列信息,但该数据集具体产生的数据文件类型、数据量、测序深度、覆盖范围、样本数量、数据格式等,源站未提供。BioProject 记录本身提供的是指向该项目下多种数据类型的链接入口,而非直接的数据文件集合。因此,该数据集的具体数据内容细节需通过 NCBI BioProject 页面进一步查看,源站未提供更详细的描述。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的一项记录。BioProject 记录通常来源于单一组织或联合体,用于汇集与某一研究计划相关的生物数据。该项目的具体样本采集方法、细胞系来源、测序平台、建库方式、数据提交机构等信息,源站未提供。本站分类为肌肉骨骼系统疾病/其他,主题标签为 Phenotype or Genotype,这些分类信息可用于辅助理解该数据集在领域中的位置,但不代表源站提供了更详细的采集信息。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与人类胎儿成骨细胞(hFOB)细胞系全基因组测序相关的表型或基因型研究场景。由于本站将其归类于肌肉骨骼系统疾病/其他,该数据集可能对肌肉骨骼系统疾病相关研究具有参考价值。然而,具体的适用分析类型、可支持的研究问题、是否可用于变异检测、基因表达分析、比较基因组学等,源站未提供。用户应结合 BioProject 记录中链接的其他数据类型,判断其是否满足特定研究需求。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以编号 PRJNA1455686 检索并访问该项目的记录页面。BioProject 记录提供统一入口,用户可从该页面查找与该项目相关的多种数据类型链接。具体的数据下载方式、访问权限、所需工具、分析流程等,源站未提供。由于该项目为全基因组测序项目,用户可能需要依据 NCBI 相关数据访问规范获取数据,但具体操作细节源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的质量指标、测序质量、数据完整性、样本代表性、潜在偏差等信息,源站未提供。该数据集为 BioProject 记录,主要提供数据链接入口,而非经过统一质控的数据集合。用户在使用时需注意,BioProject 记录本身不保证所链接数据的质量或适用性。此外,该数据集仅涉及人胎儿成骨细胞(hFOB)细胞系,其结论是否可推广至其他细胞类型或组织,源站未提供。本站分类为肌肉骨骼系统疾病/其他,主题标签为 Phenotype or Genotype,这些分类信息不构成对数据质量的评价。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用限制、是否允许商业用途、是否需要遵守特定数据共享政策等信息,源站未提供。用户在使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 记录页面及相关数据提交机构提供的引用和许可说明。由于源站未提供具体许可信息,无法在此确认该数据集的使用条件。建议用户直接访问 NCBI BioProject 页面,以获取最新的引用与许可要求。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1455686

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对hFOB 1.19人成骨细胞系(ATCC CRL-11372)进行了全基因组测序(WGS),旨在为成骨细胞生物学及骨骼疾病研究生成基因组参考资源。这些数据支持整合功能基因组学分析,以探究骨密度和骨质疏松症背后的遗传机制。该细胞系最初源自人胎儿骨组织中的成骨细胞,随后利用温度敏感的SV40大T抗原进行了永生化处理。由于此数据集来源于商业可得的永生化细胞系,它并不代表人类研究群体,因此,诸如年龄分布、种族/民族、疾病状态或疾病患病率等典型人口统计学特征并不适用……(更多内容请参见dbGaP研究页面。)

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案