OpenSkeleton:开放、分性别的全身骨骼数据集,用于统计形状建模

骨骼解剖经分割与处理,获得覆盖完整人体骨架的 182 个骨骼结构的解剖对应网格,并通过配准在保留各结构解剖几何的前提下建立受试者间对应关系

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2026-10-23 更新
浏览 2
医学影像图像分割Skeleton3D anatomyTriangulated meshFull-bodyStatistical Shape ModelSex-specific morphology
OpenSkeleton: Open, Sex-Specific Full-Body Skeletal dataset for Statistical Shape Modeling

基本信息

模态
医学影像
大小
2.983474984 GB
任务类型
图像分割
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

OpenSkeleton:开放、分性别的全身骨骼数据集,用于统计形状建模

OpenSkeleton: Open, Sex-Specific Full-Body Skeletal dataset for Statistical Shape Modeling

OpenSkeleton 提供人体解剖对应的三维骨骼网格,源自 New Mexico Decedent Image Database(NMDID)中 102 名受试者(51 女、51 男)的 CT 数据。骨骼解剖经分割与处理,获得覆盖完整人体骨架的 182 个骨骼结构的解剖对应网格,并通过配准在保留各结构解剖几何的前提下建立受试者间对应关系。该数据集可用于统计形状模型(SSM)和受试者特异性解剖模型的开发、评估与基准测试等用途(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集提供解剖对应的人体三维骨骼网格。该数据集可用于但不限于统计形状模型(SSM)和受试者特异性解剖模型的开发、评估与基准测试。该数据集由来自 New Mexico Decedent Image Database(NMDID)的 102 名受试者(51 名女性、51 名男性)的计算机断层扫描(CT)数据创建。骨骼解剖经分割和处理,以获得覆盖完整人体骨架的 182 个骨骼结构的解剖对应网格。各结构经配准以在受试者之间建立对应关系,同时保留每个结构的解剖几何。数据集内容 NM_LEXT:MATLAB 结构体,包含所有受试者下肢(LEXT)和躯干(TORSO)的数据。NM_UEXT:MATLAB 结构体,包含

【主题与分类】

主题标签:Skeleton、3D anatomy、Triangulated mesh、Full-body、Statistical Shape Model、Sex-specific morphology。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23592083

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.23592083

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 2.98 GB。

数据说明

该数据集提供了人体解剖学对应的三维骨骼网格。该数据集可用于(但不限于)统计形状模型(SSMs)和受试者特异性解剖模型的开发、评估和基准测试。该数据集由来自新墨西哥州死者图像数据库(NMDID)的102名受试者(51名女性和51名男性)的计算机断层扫描(CT)数据创建而成。对骨骼解剖结构进行了分割和处理,以获得跨越182个骨骼结构、覆盖完整人体骨骼的解剖学对应网格。对各个结构进行配准,以在受试者之间建立对应关系,同时保留每个结构的解剖几何形状。数据集内容 NM_LEXT:MATLAB结构体,包含所有受试者下肢(LEXT)和躯干(TORSO)的数据。NM_UEXT:MATLAB结构体,包含所有受试者上肢(UEXT)的数据。NM_combined:MATLAB结构体,包含下肢、躯干和上肢的数据。

上肢结构已重新定位到与下肢和躯干相同的坐标框架中,为完整骨骼提供了一个统一的坐标系统。Faces:MATLAB 结构体,包含已配准结构的面数据。Metadata:MATLAB 结构体,包含 NMDID 数据集中受试者的元数据。EXAMPLE_CreateSSM.m:示例 MATLAB 脚本,演示如何从提供的数据创建线性统计形状模型。此代码依赖于:https://nl.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/49940-shape-model-builder EXAMPLE_GetData.m:示例 MATLAB 脚本,演示如何从单个受试者中检索特定的骨骼结构。PCAData.m 和 plotshapemode.m:用于创建线性统计形状模型并绘制所得主成分的 MATLAB 脚本。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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