IDR idr0144-baskay-jawbone 实验A 颌骨影像数据集

主题标签:肌肉骨骼系统疾病、颌骨、细胞组织成像、IDR、OME、EMBL-EBI。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。本数据集为肌肉骨骼系统疾病领域公开数据集,主题涵盖肌肉骨骼系统疾病。

idr
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医学影像图像分割肌肉骨骼系统疾病颌骨细胞组织成像IDROMEEMBL-EBI
IDR idr0144-baskay-jawbone (experimentA)

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

IDR idr0144-baskay-jawbone 实验A 颌骨影像数据集

IDR idr0144-baskay-jawbone (experimentA) 是一个面向肌肉骨骼系统疾病研究的公开细胞与组织成像数据集,收录于 Image Data Resource(IDR)平台,来源为 idr.openmicroscopy.org。该数据集归属于肌肉骨骼系统疾病分类下的“其他”子类,主题标签涵盖肌肉骨骼系统疾病、颌骨、细胞组织成像、IDR、OME 与 EMBL-EBI。作为 IDR 中经过策展的细胞/组织成像研究之一,它围绕颌骨相关样本的显微成像数据组织,为肌肉骨骼系统疾病领域的研究者提供了一个可公开访问的影像资源入口。数据集规模较小,experimentA 实验部分共包含 2 幅图像,适合作为特定成像观察的示例性资料使用。

【数据集背景】

该数据集属于 Image Data Resource(IDR)中的策展研究条目,编号为 idr0144,研究主题为颌骨(jawbone),实验标识为 experimentA。IDR 是由 OME 与 EMBL-EBI 共同维护的细胞与组织成像数据资源库,其收录内容以经过策展的成像研究为主。本数据集在本站被归入肌肉骨骼系统疾病分类,并标注为“其他”子类,说明其内容与肌肉骨骼系统疾病相关,但未归入更细的疾病分类。主题标签同时包含颌骨与细胞组织成像,表明该研究的成像对象与颌骨组织相关,属于组织层面的显微成像资料。

【数据内容】

依据源站描述,experimentA 实验包含 2 幅图像。数据集主题涵盖肌肉骨骼系统疾病、颌骨、细胞组织成像等方向。除图像数量与主题标签外,源站未提供关于图像尺寸、通道数、分辨率、染色方式、样本个体数量或实验分组的进一步说明。数据集的英文名称中带有“jawbone”字样,指向颌骨这一解剖部位,但具体成像视野、组织切片或细胞类型等信息源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,即 Image Data Resource 的官方站点。源站将其描述为 IDR 研究 idr0144-baskay-jawbone 的实验 experimentA,并注明其为经过策展的细胞/组织成像研究,归属 OME/EMBL-EBI 体系。关于样本采集方法、成像仪器、成像参数、实验流程与原始数据提交者等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与分类,该数据集可用于肌肉骨骼系统疾病领域中颌骨相关组织成像的观察与参考,也可作为细胞与组织成像类公开数据的示例资源,用于影像数据组织方式、元数据结构的了解,以及教学演示中对公开成像数据集的使用。由于数据集仅含 2 幅图像,其适用场景以示例性、参考性用途为主。关于该数据集是否适用于特定的定量分析、算法训练或对照研究,源站未提供相应说明。

【使用方法】

该数据集可通过 idr.openmicroscopy.org 访问,属于 IDR 平台上的公开策展研究条目。关于具体的下载方式、图像格式、访问协议、是否需要账号以及可用的检索接口等信息,源站未提供。使用者可依据 IDR 平台的一般访问方式获取该研究条目下的图像资源,但本数据集特有的使用指引源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 IDR 策展研究,来源站标注其为 curated cell/tissue imaging study,表明其经过策展流程。数据集规模有限,experimentA 仅包含 2 幅图像,样本量与图像数量均较小,难以支撑统计意义上的群体分析。关于图像质量评估、元数据完整度、是否存在批次效应或技术偏倚等信息,源站未提供。使用者在将其用于研究结论支撑时,应注意其小规模示例性质。

【引用与许可】

该数据集归属 OME/EMBL-EBI 的 Image Data Resource 体系,源站描述中未给出具体的引用文献、数据提交者名单或许可条款。关于引用格式、许可类型与使用限制,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应自行查阅 IDR 平台上该研究条目的官方页面以确认相关要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-2501

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0144-baskay-jawbone. Experiment: experimentA. Images: 2. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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