克罗恩病患者脊柱关节炎粪便微生物标志物识别

该数据集来自 clinicaltrials.gov,属于肌肉骨骼系统疾病分类下的 MICROSPA 项目。项目旨在比较克罗恩病(CD)是否合并脊柱关节炎(SpA)患者的肠道微生物、血清细胞因子和外周血单个核细胞(PBMC)

Central Hospital, Nancy, FranceCentral Hospital, Nancy, France
clinicaltrials
浏览 11
基因组分类Crohn DiseaseSpondyloarthritis
基因组Identification of Fecal Microbiota Biomarkers of Spondyloarthritis in Patients Suffering From Crohn's Disease.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-13

资源简介

克罗恩病患者脊柱关节炎粪便微生物标志物识别

该数据集英文名为 Identification of Fecal Microbiota Biomarkers of Spondyloarthritis in Patients Suffering From Crohn's Disease,来源于 clinicaltrials.gov,本站归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他。数据集围绕 MICROSPA 项目展开,该项目旨在比较克罗恩病(CD)患者是否合并脊柱关节炎(SpA)时的肠道微生物、血清细胞因子和外周血单个核细胞(PBMC)。研究设置了三组患者分析对象,分别为单纯克罗恩病患者、单纯脊柱关节炎患者以及同时患有克罗恩病和脊柱关节炎的患者,并纳入一组健康对照作为比较。粪便微生物将通过细菌组、病毒组和真菌组的 NGS 测序进行测定。主题标签包括 Crohn Disease 和 Spondyloarthritis。

【数据集背景】

该数据集对应的 MICROSPA 项目关注克罗恩病与脊柱关节炎之间的关系。克罗恩病和脊柱关节炎是两种可能同时出现的疾病,项目试图通过比较不同患者群体的肠道微生物、血清细胞因子和外周血单个核细胞,来识别与脊柱关节炎相关的粪便微生物生物标志物。研究设计包含三组患者和一组健康对照,目的是在克罗恩病是否合并脊柱关节炎的条件下进行对比分析。

【数据内容】

数据集涉及的主要数据内容包括肠道微生物、血清细胞因子和外周血单个核细胞(PBMC)。其中,粪便微生物将通过细菌组、病毒组和真菌组的 NGS 测序进行测定。分析对象分为三组患者:单纯克罗恩病患者、单纯脊柱关节炎患者、同时患有克罗恩病和脊柱关节炎的患者;此外还有一组健康对照作为比较。源站未提供具体的样本量、测序平台、细胞因子种类、PBMC 检测方法、数据文件格式或数据记录数量等信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov。源站描述指出,MICROSPA 项目将比较克罗恩病是否合并脊柱关节炎患者的肠道微生物、血清细胞因子和 PBMC。粪便微生物的测定方式为细菌组、病毒组和真菌组的 NGS 测序。除上述来源和采集对象外,源站未提供采集时间、采集地点、招募方式、伦理审批信息或具体操作流程等细节。

【适用场景】

该数据集适用于与克罗恩病、脊柱关节炎及其共病相关的微生物组研究、细胞因子分析和免疫细胞研究。潜在应用方向包括比较单纯克罗恩病、单纯脊柱关节炎、克罗恩病合并脊柱关节炎患者以及健康对照之间的肠道微生物差异,探索粪便微生物作为脊柱关节炎生物标志物的可能性,以及结合血清细胞因子和 PBMC 数据开展多维度分析。源站未提供该数据集在特定研究设计、统计方法或临床决策中的具体适用说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据访问方式、下载格式、预处理步骤、分析流程、软件工具或代码示例等。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息、样本量、缺失值情况、批次效应、测序深度、对照设置细节或任何已知限制。由于缺乏这些信息,无法对数据集的完整性、偏倚风险或可重复性作出判断。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可协议、使用条款或数据共享政策。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03983473

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:克罗恩病、脊柱关节炎。MICROSPA项目旨在比较伴有或不伴有脊柱关节炎(SpA)的克罗恩病(CD)患者的肠道微生物群、血清细胞因子和外周血单核细胞(PBMC)。将分析3组患者:单纯CD患者、单纯SpA患者、CD合并SpA患者。另设一组健康对照作为比较对象。粪便微生物群将通过细菌组、病毒组和真菌组的NGS测序进行测定。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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