克罗恩病患者脊柱关节炎粪便微生物标志物识别
该数据集来自 clinicaltrials.gov,属于肌肉骨骼系统疾病分类下的 MICROSPA 项目。项目旨在比较克罗恩病(CD)是否合并脊柱关节炎(SpA)患者的肠道微生物、血清细胞因子和外周血单个核细胞(PBMC)
基本信息
资源简介
克罗恩病患者脊柱关节炎粪便微生物标志物识别
该数据集英文名为 Identification of Fecal Microbiota Biomarkers of Spondyloarthritis in Patients Suffering From Crohn's Disease,来源于 clinicaltrials.gov,本站归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他。数据集围绕 MICROSPA 项目展开,该项目旨在比较克罗恩病(CD)患者是否合并脊柱关节炎(SpA)时的肠道微生物、血清细胞因子和外周血单个核细胞(PBMC)。研究设置了三组患者分析对象,分别为单纯克罗恩病患者、单纯脊柱关节炎患者以及同时患有克罗恩病和脊柱关节炎的患者,并纳入一组健康对照作为比较。粪便微生物将通过细菌组、病毒组和真菌组的 NGS 测序进行测定。主题标签包括 Crohn Disease 和 Spondyloarthritis。
【数据集背景】
该数据集对应的 MICROSPA 项目关注克罗恩病与脊柱关节炎之间的关系。克罗恩病和脊柱关节炎是两种可能同时出现的疾病,项目试图通过比较不同患者群体的肠道微生物、血清细胞因子和外周血单个核细胞,来识别与脊柱关节炎相关的粪便微生物生物标志物。研究设计包含三组患者和一组健康对照,目的是在克罗恩病是否合并脊柱关节炎的条件下进行对比分析。
【数据内容】
数据集涉及的主要数据内容包括肠道微生物、血清细胞因子和外周血单个核细胞(PBMC)。其中,粪便微生物将通过细菌组、病毒组和真菌组的 NGS 测序进行测定。分析对象分为三组患者:单纯克罗恩病患者、单纯脊柱关节炎患者、同时患有克罗恩病和脊柱关节炎的患者;此外还有一组健康对照作为比较。源站未提供具体的样本量、测序平台、细胞因子种类、PBMC 检测方法、数据文件格式或数据记录数量等信息。
【采集与来源】
该数据集来源于 clinicaltrials.gov。源站描述指出,MICROSPA 项目将比较克罗恩病是否合并脊柱关节炎患者的肠道微生物、血清细胞因子和 PBMC。粪便微生物的测定方式为细菌组、病毒组和真菌组的 NGS 测序。除上述来源和采集对象外,源站未提供采集时间、采集地点、招募方式、伦理审批信息或具体操作流程等细节。
【适用场景】
该数据集适用于与克罗恩病、脊柱关节炎及其共病相关的微生物组研究、细胞因子分析和免疫细胞研究。潜在应用方向包括比较单纯克罗恩病、单纯脊柱关节炎、克罗恩病合并脊柱关节炎患者以及健康对照之间的肠道微生物差异,探索粪便微生物作为脊柱关节炎生物标志物的可能性,以及结合血清细胞因子和 PBMC 数据开展多维度分析。源站未提供该数据集在特定研究设计、统计方法或临床决策中的具体适用说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据访问方式、下载格式、预处理步骤、分析流程、软件工具或代码示例等。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息、样本量、缺失值情况、批次效应、测序深度、对照设置细节或任何已知限制。由于缺乏这些信息,无法对数据集的完整性、偏倚风险或可重复性作出判断。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可协议、使用条款或数据共享政策。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03983473
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:克罗恩病、脊柱关节炎。MICROSPA项目旨在比较伴有或不伴有脊柱关节炎(SpA)的克罗恩病(CD)患者的肠道微生物群、血清细胞因子和外周血单核细胞(PBMC)。将分析3组患者:单纯CD患者、单纯SpA患者、CD合并SpA患者。另设一组健康对照作为比较对象。粪便微生物群将通过细菌组、病毒组和真菌组的NGS测序进行测定。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




