肌肉骨骼疾病三个潜在因子的GWAS汇总统计

该数据集包含使用基因组结构方程模型生成的、与肌肉骨骼疾病相关的三个潜在因子的GWAS汇总统计。表型为:MSKdg:退行性肌肉骨骼疾病因子;MSKbm:骨量因子;MSKai:自身免疫性疾病因子

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基因组回归肌肉骨骼系统疾病GWAS汇总统计基因组结构方程模型潜在因子骨量自身免疫性疾病退行性肌肉骨骼疾病
GWAS summary statistics for three latent factors of musculoskeletal disorders

基本信息

模态
基因组
大小
0.640172153 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

肌肉骨骼疾病三个潜在因子的GWAS汇总统计

该数据集收录了与肌肉骨骼疾病相关的三个潜在因子的GWAS汇总统计结果,这些结果通过基因组结构方程模型生成。所涉及的表型包括退行性肌肉骨骼疾病因子(MSKdg)、骨量因子(MSKbm)以及自身免疫性疾病因子(MSKai)。数据集由Gong, Weiming、Guo, Yantong、Sun, Xiubin、Wang, Shukang、Xue, Fuzhong、Zhao, Wei、Zhou, Xiang、Liu, Lu、Yuan, Zhongshang共同完成,存放于Zenodo,发布时间为2026年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。该数据集对应的研究为《Multivariate genetic analysis reveals three distinct pathological dimensions in musculoskeletal disorders》(已接收),旨在从多变量遗传学角度刻画肌肉骨骼疾病的不同病理维度,为相关遗传学研究提供可复用的汇总统计数据。

【数据集背景】

肌肉骨骼疾病涵盖范围广泛,不同亚型在遗传机制上可能存在差异。传统单表型GWAS往往难以揭示疾病之间共享或特异的遗传结构。该数据集对应的研究采用基因组结构方程模型,从多变量角度提取出三个潜在因子,分别对应退行性肌肉骨骼疾病、骨量和自身免疫性疾病三个病理维度。这一分析框架有助于在遗传层面区分肌肉骨骼疾病的不同病理成分,为后续的机制研究和风险分层提供基础数据。

【数据内容】

数据集的核心内容是三个潜在因子的GWAS汇总统计,表型命名分别为MSKdg(退行性肌肉骨骼疾病因子)、MSKbm(骨量因子)和MSKai(自身免疫性疾病因子)。这些汇总统计由基因组结构方程模型生成,属于多变量遗传分析的结果形式。除上述表型名称与统计类型外,源站未提供各因子所包含的具体变异位点数量、样本量、统计指标种类等细节。

【采集与来源】

数据来源于doi.org所指向的存储记录,机构为Zenodo。数据由上述作者团队生成并发布,发布时间为2026年。源站未提供具体的样本采集流程、原始队列来源、基因分型平台或质控步骤等信息。

【适用场景】

该数据集适用于肌肉骨骼疾病遗传结构的后续分析,例如基于汇总统计的遗传相关性评估、孟德尔随机化分析、多性状联合分析以及与其他GWAS数据的整合研究。三个潜在因子的划分也便于研究者分别考察退行性病变、骨量与自身免疫成分的遗传基础。具体适用性需结合研究者自身分析设计与数据特征判断,源站未提供针对特定应用的验证说明。

【使用方法】

使用者可依据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获取并使用该数据集。源站未提供文件格式、字段说明、读取工具或分析代码等具体使用指引,使用前需自行确认数据结构与统计指标含义。

【质量与限制】

该数据集基于基因组结构方程模型生成,其质量取决于原始GWAS数据与分析模型。源站未提供质控指标、批次效应评估、人群 ancestry 构成或验证结果等信息。潜在因子为统计建模产物,其生物学解释需谨慎对待。源站未提供其他限制说明。

【引用与许可】

使用该数据集时应引用对应研究《Multivariate genetic analysis reveals three distinct pathological dimensions in musculoskeletal disorders》(已接收)及数据记录本身。许可为Creative Commons Attribution 4.0 International,允许在署名条件下使用、共享与改编。源站未提供具体引用格式或数据DOI细节。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.19012445

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 640.2 MB。

数据说明

该数据集包含通过基因组结构方程模型生成的与肌肉骨骼疾病相关的三个潜在因子的GWAS汇总统计数据。表型为:MSKdg:退行性肌肉骨骼疾病因子MSKbm:骨量因子MSKai:自身免疫性疾病因子发表文章:多变量遗传分析揭示肌肉骨骼疾病中的三个不同病理维度(已接收)

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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