GSE243339:幼年皮肌炎驱动因素线索——I型干扰素与JAK抑制剂处理后儿童生物工程骨骼肌的遗传改变

主题标签:幼年皮肌炎、I型干扰素、JAK抑制剂、生物工程骨骼肌、基因表达、GEO数据集。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。本数据集为肌肉骨骼系统疾病领域公开数据集,主题涵盖幼年皮肌炎。

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基因组分类幼年皮肌炎I型干扰素JAK抑制剂生物工程骨骼肌基因表达GEO数据集
GSE243339: Clues to Drivers of Juvenile Dermatomyositis: Genetic Alterations after Type I Interferon and JAK Inhibitor Treatment in Pediatric Bioengineered Skeletal Muscle

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

GSE243339:幼年皮肌炎驱动因素线索——I型干扰素与JAK抑制剂处理后儿童生物工程骨骼肌的遗传改变

GSE243339 是一个聚焦幼年皮肌炎致病驱动因素的公开基因表达数据集,全称为“Clues to Drivers of Juvenile Dermatomyositis: Genetic Alterations after Type I Interferon and JAK Inhibitor Treatment in Pediatric Bioengineered Skeletal Muscle”。该数据集围绕幼年皮肌炎这一肌肉骨骼系统疾病,在儿童生物工程骨骼肌模型中考察I型干扰素与JAK抑制剂处理后的基因改变,主题标签涵盖幼年皮肌炎、I型干扰素、JAK抑制剂、生物工程骨骼肌与基因表达。数据集来源于 NCBI Gene Expression Omnibus(GEO),并通过 usebiotransfer.org 的 GEO 检索工具对外提供入口,本站将其归入肌肉骨骼系统疾病/其他类别,供相关领域的研究者检索与使用。

【数据集背景】

幼年皮肌炎是一种累及儿童肌肉与皮肤的疾病,其发病机制与I型干扰素通路的关系受到关注,JAK抑制剂则作为干预该通路的候选手段被研究。该数据集正是围绕“幼年皮肌炎的驱动因素”这一科学问题构建,试图在儿童生物工程骨骼肌这一实验体系中,观察I型干扰素处理及JAK抑制剂处理之后发生的基因层面改变,从而为理解疾病驱动机制和药物干预效果提供转录组层面的线索。数据集的标题直接点明了三个核心要素:I型干扰素、JAK抑制剂处理,以及儿童生物工程骨骼肌模型。

【数据内容】

该数据集属于基因表达类数据,主题涵盖幼年皮肌炎、I型干扰素、JAK抑制剂、生物工程骨骼肌与基因表达。其设计对应在儿童生物工程骨骼肌中开展的处理实验,比较I型干扰素与JAK抑制剂作用后出现的遗传/基因表达改变。关于样本数量、分组设置、测序平台、具体基因列表及差异表达结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集通过 NCBI Gene Expression Omnibus 发布,编号为 GSE243339,并经由 usebiotransfer.org 的 GEO 检索入口(https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE243339/)提供访问信息。本站将其归类为肌肉骨骼系统疾病/其他。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、实验操作细节等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肌肉骨骼系统疾病领域的研究,尤其是幼年皮肌炎相关机制探索。典型用途包括:考察I型干扰素刺激在儿童骨骼肌模型中的基因表达响应;评估JAK抑制剂对上述响应的逆转或调节作用;为幼年皮肌炎的候选驱动基因与通路假设提供数据支撑;以及作为生物工程骨骼肌体外模型相关研究的参考数据。具体分析方向需结合使用者自身研究设计确定。

【使用方法】

使用者可通过 usebiotransfer.org 提供的 GEO 检索入口定位该数据集,并依据 NCBI Gene Expression Omnibus 的常规流程获取与使用数据。关于数据下载格式、预处理步骤、标准化方法及分析工具建议,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开的基因表达数据集,其价值在于围绕幼年皮肌炎与I型干扰素/JAK抑制剂干预提供转录组层面的观察。需要说明的是,数据基于儿童生物工程骨骼肌这一体外模型,向临床或体内情况的推广需谨慎。关于样本量、批次效应、数据完整性及验证程度等质量相关信息,源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时,应标注其标题“GSE243339: Clues to Drivers of Juvenile Dermatomyositis: Genetic Alterations after Type I Interferon and JAK Inhibitor Treatment in Pediatric Bioengineered Skeletal Muscle”及来源 NCBI Gene Expression Omnibus,并可注明经 usebiotransfer.org 的 GEO 检索入口获取。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE243339

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

NCBI Gene Expression Omnibus, GSE243339: Clues to Drivers of Juvenile Dermatomyositis: Genetic Alterations after Type I Interferon and JAK Inhibitor Treatment in Pediatric Bioengineered Skeletal Muscle [Dataset]. https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE243339/

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