E-GEOD-83415:幼年特发性关节炎(JIA)CD4+ T细胞基因表达生物标志物

该数据集来自 EBI 的 Expression Atlas 差异表达实验,物种为 Homo sapiens,主题为幼年特发性关节炎(JIA)中基于 CD4+ T 细胞基因表达的生物标志物

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基因组分类Differential
E-GEOD-83415: CD4+ T Cells Gene Expression-Based Biomarkers in Juvenile Idiopathic Arthritis (JIA)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

E-GEOD-83415:幼年特发性关节炎(JIA)CD4+ T细胞基因表达生物标志物

E-GEOD-83415 是一个来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,全称为 CD4+ T Cells Gene Expression-Based Biomarkers in Juvenile Idiopathic Arthritis (JIA)。该数据集聚焦于人类(Homo sapiens)幼年特发性关节炎(JIA)中基于 CD4+ T 细胞基因表达的生物标志物,属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类。作为 Expression Atlas 中的差异表达实验,其主题标签为 Differential,意味着该数据集的核心在于比较不同条件下 CD4+ T 细胞基因表达的差异,以识别潜在的生物标志物。该数据集来源于 ebi.ac.uk,可为研究者提供关于 JIA 相关基因表达变化的数据资源。

【数据集背景】

幼年特发性关节炎(JIA)是一类发生于儿童时期的慢性关节炎,其发病机制涉及免疫系统异常,其中 CD4+ T 细胞在免疫调节和炎症过程中扮演重要角色。寻找基于 CD4+ T 细胞基因表达的生物标志物,有助于理解 JIA 的分子机制、辅助诊断或评估疾病活动度。该数据集正是围绕这一目标而构建的差异表达实验,属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类,来源于 EBI 的 Expression Atlas 平台。源站描述指出,该实验的物种为 Homo sapiens,主题为 CD4+ T 细胞基因表达-based biomarkers in Juvenile Idiopathic Arthritis (JIA)。关于该数据集的具体研究背景、实验设计细节及样本来源等,源站未提供更多信息。

【数据内容】

该数据集为 Expression Atlas 中的差异表达实验(Differential),主题标签为 Differential。其核心内容涉及 CD4+ T 细胞基因表达数据,旨在识别 JIA 中基于 CD4+ T 细胞的基因表达生物标志物。物种为 Homo sapiens。数据集英文名称为 E-GEOD-83415: CD4+ T Cells Gene Expression-Based Biomarkers in Juvenile Idiopathic Arthritis (JIA)。关于具体的基因数量、样本数量、表达值矩阵、差异表达基因列表或统计结果等详细数据内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即欧洲生物信息研究所(EBI)的 Expression Atlas 平台。源站描述明确其为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens。数据集编号为 E-GEOD-83415。关于样本采集方式、组织来源、实验平台、测序或芯片技术、数据处理流程等具体采集与来源信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与幼年特发性关节炎(JIA)相关的基因表达研究,特别是聚焦于 CD4+ T 细胞的差异表达分析。潜在应用包括:识别 JIA 中基于 CD4+ T 细胞的候选生物标志物、比较不同条件下 CD4+ T 细胞的基因表达变化、以及作为差异表达实验数据用于方法学验证或整合分析。由于该数据集属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类,也可为肌肉骨骼系统疾病领域的生物标志物发现提供参考。关于具体的适用疾病亚型、临床分组或实验条件,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 EBI Expression Atlas 平台访问,用户可依据数据集编号 E-GEOD-83415 进行检索。作为差异表达实验,用户可查看或下载相关的基因表达差异结果,用于后续分析。具体的数据下载格式、分析工具、可视化方式或 API 接口等使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 EBI Expression Atlas,属于经过整理的差异表达实验,但其具体质量指标(如数据完整性、重复性、标准化方法等)源站未提供。限制方面,由于仅基于 CD4+ T 细胞基因表达,可能无法全面反映 JIA 的复杂病理过程;且该数据集为差异表达实验,可能不包含原始测序读数或完整表达矩阵。关于样本量、统计显著性阈值、批次效应等质量与限制细节,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,具体引用方式、许可协议或使用条款源站未提供。用户在使用时应遵循 EBI Expression Atlas 平台的相关规定,并参考原始数据集 E-GEOD-83415 的发布信息。关于引用格式、许可类型或数据共享政策,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-83415

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. CD4+ T Cells Gene Expression-Based Biomarkers in Juvenile Idiopathic Arthritis (JIA)

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