胶原蛋白 alpha-2(I) 链降解组基础图谱

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5522/04/34021824

标准获取流程：

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数据说明

本Figshare存储库托管了胶原蛋白α-2(I)降解组基础图谱（版本1），这是一个通过人类胶原蛋白α-2(I)（COL1A2）蛋白水解切割生成的理论肽段景观的综合计算机模拟重建。该图谱为蛋白质组学、降解组学、质谱分析、细胞外基质生物学、结缔组织研究和生物标志物发现领域的研究人员提供了一个开放获取的计算参考。通过系统性地绘制由COL1A2周转和酶促加工产生的潜在肽段片段，该数据集提供了以降解组为中心的视角，揭示了细胞外基质重塑和胶原蛋白周转过程中可能产生的动态肽段群体。生物学背景：胶原蛋白α-2(I)由COL1A2编码，是构成I型胶原蛋白的两条组成性胶原链之一，I型胶原蛋白是人体中最丰富的纤维状胶原蛋白。

I型胶原主要以异源三聚体形式组装，包含两条alpha-1(I)链和一条alpha-2(I)链，为多种结缔组织提供抗张强度、结构完整性和机械支持。因此，COL1A2是骨、皮肤、肌腱、韧带、角膜及其他结缔组织等组织细胞外基质的重要组成部分。I型胶原的持续合成、组装、交联、重塑和降解对于维持组织结构以及应对损伤和生理变化至关重要。I型胶原的蛋白水解加工可产生大量胶原衍生肽和片段。这些降解产物可能包含关于细胞外基质周转的分子信息，而仅测量完整胶原无法捕捉到这些信息。因此，绘制理论上的COL1A2片段图谱为研究胶原衍生肽作为基质重塑和组织特异性生物过程的潜在指标提供了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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