银屑病、银屑病关节炎、仅皮肤银屑病患者及健康对照的特征与人口学数据

该数据集来自 plos.figshare.com,包含银屑病、银屑病关节炎、仅皮肤银屑病患者及健康对照的特征与人口学信息,并涉及从患者与健康对照皮肤组织中鉴定的 PANoptosis 相关特征(PANoptosis-sig)

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2024-10-31 更新
浏览 2
时间序列分类two distinct subtypesil &# 8722enrichment analysis showed17 signaling pathwayinflammatory skin diseaseimmune landscape showedimmune infiltration analysismast cells restingdendritic cells activatedxlink "> psoriasisrelated signatures correlateschronic inflammatory response
Characteristics and demographics of patients with psoriasis, psoriatic arthritis, cutaneous only psoriasis, and healthy controls.

基本信息

模态
时间序列
大小
0.000163526 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-10-31
版本
v1

资源简介

银屑病、银屑病关节炎、仅皮肤银屑病患者及健康对照的特征与人口学数据

DEPs of psoriasis and healthy controls.

该数据集来自 plos.figshare.com,包含银屑病、银屑病关节炎、仅皮肤银屑病患者及健康对照的特征与人口学信息,并涉及从患者与健康对照皮肤组织中鉴定的 PANoptosis 相关特征(PANoptosis-sig)。数据可用于探索银屑病不同亚型的免疫与炎症特征、PANoptosis 机制,以及基于转录与蛋白水平的分类分析(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2024-10-31。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):银屑病是一种频繁复发的炎症性皮肤病。角质形成细胞凋亡失调在银屑病的病理机制中起关键作用。PANoptosis 是焦亡、凋亡和坏死性凋亡之间分子相互作用的过程。PANoptosis 在银屑病发生发展中的机制仍不清楚。在此,我们提出一种新方法,从银屑病患者和健康对照的皮肤组织中在转录和蛋白水平鉴定 PANoptosis 相关特征(PANoptosis-sig)。共鉴定出五个 PANoptosis-sig(TYMP、S100A8、S100A9、NAMPT、LCN2)。富集分析显示它们主要富集于对白细胞聚集、白细胞迁移、慢性炎症反应和 IL−17 信号通路的响应。单细胞转录组分析显示 TYMP 和 NAMPT 在几乎所有细胞群中表达

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 163.53 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0310362.s007。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology。主题标签:two distinct subtypes、il &# 8722、enrichment analysis showed、17 signaling pathway、inflammatory skin disease、immune landscape showed、immune infiltration analysis、mast cells resting、dendritic cells activated、related signatures correlates。本站分类:肌肉骨骼系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/DEPs_of_psoriasis_and_healthy_controls_/27385785

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Wu, Li; Jiao, Xin-long; Jing, Ming; Zhang, Sheng-xiao; Wang, Yang; Li, Chen-long; et al. (2024). DEPs of psoriasis and healthy controls.. PLOS ONE. Dataset

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命令行下载

curl -L -o "pone.0310362.s007.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/50116890"

文件清单

  • pone.0310362.s007.xlsx(163.53 KB)

文件总体积 163.53 KB(源站 API 实测)。

数据说明

银屑病是一种频繁复发的炎症性皮肤病。角质形成细胞凋亡失调在银屑病的病理机制中起着至关重要的作用。PANoptosis是一个涉及焦亡、凋亡和坏死性凋亡之间分子相互作用的过程。PANoptosis在银屑病发生和发展中的机制仍不清楚。在此,我们提出了一种新方法,通过从银屑病患者和健康对照者的皮肤组织中在转录和蛋白质水平上识别PANoptosis相关特征(PANoptosis-sig)。共识别出五个PANoptosis-sig(TYMP、S100A8、S100A9、NAMPT、LCN2)。富集分析显示,它们主要富集于对白细胞聚集、白细胞迁移、慢性炎症反应和IL−17信号通路的响应。单细胞转录组分析显示,TYMP和NAMPT几乎在所有细胞群体中表达,而LCN2、S100A8和S100A9在角质形成细胞中显著高表达。随后,我们利用PANoptosis-sig构建了预测和诊断模型,并评估了其性能。

最后,采用无监督共识聚类分析,通过PANoptosis-sig确定银屑病分子亚型。银屑病队列被分为两个不同的亚型。免疫景观显示,聚类1的基质评分显著高于聚类2,而聚类2的免疫评分和ESTIMATE评分显著高于聚类1。在免疫浸润分析中,聚类1表现出浆细胞、调节性T细胞(Tregs)和静息态肥大细胞的高表达,而聚类2则表现出T细胞、M1型巨噬细胞、活化态树突状细胞和中性粒细胞的高表达。此外,聚类2对免疫检查点更为敏感。总之,我们的研究揭示了用于银屑病预防、诊断和治疗的潜在生物标志物及治疗靶点,加深了我们对PANoptosis潜在分子机制的理解。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0310362.s007(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/DEPs_of_psoriasis_and_healthy_controls_/27385785)。

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