脓毒症心肌病特征基因与免疫关联的探索与验证数据集
该数据集包含小鼠和人类的心肌转录组数据，通过分析脓毒症心肌病模型，识别出THBS1和TIMP1两个特征基因，并探究其与免疫细胞浸润的关联，主要应用于脓毒症心肌病的生物标志物发现、免疫机制研究和临床预后评估，为理解该疾病的分子机制提供重要数据支持。
基本信息
资源简介
脓毒症心肌病特征基因与免疫关联的探索与验证数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Exploration and validation of signature genes and immune associations in septic cardiomyopathy》。配套论文《Exploration and validation of signature genes and immune associations in septic cardiomyopathy》发表于 Clinical and Experimental Hypertension（2024），DOI：10.1080/10641963.2024.2302570。项目资助方：This work was supported by the Natural Science Foundation of Chongqing Science and Technology Commission under Grant [cstc2020jcyj-msxmX0919],CQMU Program for Youth Innovation in Future Medicine [W0133], the Senior Medical Talents Program of Chongqing for Young and Middle-Aged, and the Kuanren Talents Program of the Second Affiliated Hospital of Chongqing Medical University.。源站首次发布：2024-01-28。
【数据内容】
源站原始描述：An early and accurate diagnosis of septic cardiomyopathy is vital for improving the overall prognosis of sepsis. In our research, we aimed to identify signature genes and their immune connections in septic cardiomyopathy. By analyzing the mouse myocardial transcriptome from sepsis induced by cecum ligation and puncture (CLP), we identified four distinct k-means clusters. Further analysis of human myocardial datasets using Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) revealed a strong cor…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 194.40 KB。Supplemental_table_1.xls：application/vnd.ms-excel，172.54 KB。Supplemental_table_2.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，21.86 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.25097405.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Space Science、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Physiology、Immunology。主题标签：Septic cardiomyopathy、weighted gene co-expression network analysis、immune infiltration analysis。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Space Science、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Physiology、Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Exploration_and_validation_of_signature_genes_and_immune_associations_in_septic_cardiomyopathy/25097405
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Exploration and validation of signature genes and immune associations in septic cardiomyopathy. Taylor & Francis. Zhao, Zhengbo; Wang, Xiaojing; Tan, Fangyan; Liu, Han; Chen, Wan; Wang, Jing; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-12-16，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集旨在通过转录组学分析识别脓毒症心肌病的特征基因及其免疫关联。数据集包含小鼠心肌转录组数据（通过盲肠结扎穿刺法诱导脓毒症模型）以及人类心肌数据集。通过k-means聚类、加权基因共表达网络分析（WGCNA）和Cytoscape MCODE插件分析，识别出THBS1和TIMP1两个特征基因。研究进一步使用CIBERSORT方法分析免疫细胞浸润，并通过外部数据集验证了这些基因的预后潜力。实验验证显示THBS1和TIMP1在脓毒症小鼠心脏中表达上调。该数据集主要应用于脓毒症心肌病的生物标志物发现、免疫机制研究和预后评估。
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