脓毒症心肌病特征基因与免疫关联的探索与验证数据集
该数据集包含小鼠和人类的心肌转录组数据，通过分析脓毒症心肌病模型，识别出THBS1和TIMP1两个特征基因，并探究其与免疫细胞浸润的关联，主要应用于脓毒症心肌病的生物标志物发现、免疫机制研究和临床预后评估，为理解该疾病的分子机制提供重要数据支持。
创建时间2024-01-28
更新时间2024-12-16
原始链接
https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Exploration_and_validation_of_signature_genes_and_immune_associations_in_septic_cardiomyopathy/25097405/1
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资源简介
该数据集旨在通过转录组学分析识别脓毒症心肌病的特征基因及其免疫关联。数据集包含小鼠心肌转录组数据（通过盲肠结扎穿刺法诱导脓毒症模型）以及人类心肌数据集。通过k-means聚类、加权基因共表达网络分析（WGCNA）和Cytoscape MCODE插件分析，识别出THBS1和TIMP1两个特征基因。研究进一步使用CIBERSORT方法分析免疫细胞浸润，并通过外部数据集验证了这些基因的预后潜力。实验验证显示THBS1和TIMP1在脓毒症小鼠心脏中表达上调。该数据集主要应用于脓毒症心肌病的生物标志物发现、免疫机制研究和预后评估。
提供机构：Wang, Xiaojing; Liu, Han; Deng, Songbai; Chen, Wan; Wang, Jing; Zhao, Zhengbo; Du, Jianlin; Tan, Fangyan
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