流感病毒在单个细胞中感染极端异质性数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/null

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集基于单细胞mRNA测序技术，研究流感病毒感染对单个细胞转录组的影响。数据包含感染流感病毒后单个细胞的转录组测序结果，揭示了病毒感染在细胞水平上的极端异质性：不同细胞中病毒转录本占比从不足总mRNA的1%到超过50%不等，部分细胞甚至缺失某些病毒基因表达。数据还记录了细胞基因表达与病毒mRNA丰度的共变关系，以及先天免疫通路的激活情况。该数据集为研究病毒感染机制、宿主-病毒相互作用以及单细胞水平上的病毒转录动力学提供了重要资源。

数据加载示例（表格/文本类）

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))