感染数据集

该数据集为实验研究数据,记录了在不同温度、物种、基因型和病毒株处理组合下,通过PCR检测评估的两栖动物蛙病毒感染率结果,包含感染个体数和未感染个体数等结构化数据,主要用于研究环境因素与生物因素对感染流行率的影响,支持传染病学、生态免疫学及病毒-宿主相互作用等领域的研究。

DataONE
2014-05-05 更新
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病毒感染生物实验

基本信息

创建/更新时间
2014-05-05

资源简介

该数据集记录了不同处理组合下的感染流行率结果。数据集包含六个关键维度:1)温度条件(冷:14ºC和暖:22ºC);2)物种类型(北方豹蛙和木蛙);3)三种基因型(两窝木蛙和一窝豹蛙);4)三种蛙病毒株(azaC、SsMeV和野生型wt-FV3);5)通过PCR检测评估感染情况;6)各处理组合下的未感染个体数。数据来源于实验研究,采用已发表的蛙病毒MCP引物进行PCR检测,记录了每个处理组合中的感染个体数量。该数据集主要用于研究环境因素(温度)、物种差异、基因型和病毒株对感染率的影响,适用于传染病学、生态免疫学、病毒-宿主相互作用以及两栖动物保护研究。

原始链接

https://search.dataone.org/view/null

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    • OpenDataLab: pip install openxlabopenxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscopemodelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集记录了不同处理组合下的感染流行率结果。数据集包含六个关键维度:1)温度条件(冷:14ºC和暖:22ºC);2)物种类型(北方豹蛙和木蛙);3)三种基因型(两窝木蛙和一窝豹蛙);4)三种蛙病毒株(azaC、SsMeV和野生型wt-FV3);5)通过PCR检测评估感染情况;6)各处理组合下的未感染个体数。数据来源于实验研究,采用已发表的蛙病毒MCP引物进行PCR检测,记录了每个处理组合中的感染个体数量。该数据集主要用于研究环境因素(温度)、物种差异、基因型和病毒株对感染率的影响,适用于传染病学、生态免疫学、病毒-宿主相互作用以及两栖动物保护研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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