活动性或潜伏性结核病患者单核细胞经PPD体外刺激后的表达数据
该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验，物种为 Homo sapiens，样本为活动性或潜伏性结核病患者的单核细胞，并在体外经 PPD 刺激
基本信息
资源简介
活动性或潜伏性结核病患者单核细胞经PPD体外刺激后的表达数据
E-MTAB-8162 是一项聚焦结核病免疫应答的转录组差异表达实验数据集，全称为“Monocytes from people with active or latent TB stimulated in vitro with PPD”。该数据集收录于 EBI Expression Atlas，物种为 Homo sapiens，研究对象为活动性结核病或潜伏性结核病患者的单核细胞，这些细胞在体外经 PPD（纯化蛋白衍生物）刺激后进行表达谱检测。数据集以差异表达为主题标签，属于感染 / 结核病分类，可用于观察不同结核感染状态下单核细胞对 PPD 刺激的转录响应差异。整体而言，该数据集为研究宿主单核细胞在结核分枝杆菌抗原刺激下的免疫反应提供了可比较的表达数据资源。
【数据集背景】
结核病由结核分枝杆菌引起，宿主免疫系统尤其是单核细胞、巨噬细胞在感染控制与病理过程中发挥关键作用。活动性结核与潜伏性结核感染代表两种不同的宿主—病原体相互作用状态，其外周血单核细胞在体外接受结核特异性抗原 PPD 刺激后的基因表达差异，有助于理解保护性免疫与疾病进展之间的分子区别。该数据集正是围绕这一科学问题构建的差异表达实验，来源于 EBI Expression Atlas，属于感染 / 结核病主题下的转录组研究资源。
【数据内容】
该数据集的核心内容是活动性或潜伏性结核病患者单核细胞在体外经 PPD 刺激后的基因表达差异结果。源站将其标注为 Expression Atlas experiment（Differential），主题标签为 Differential，说明数据以差异表达分析为主要呈现形式。物种为 Homo sapiens。样本涉及两类人群来源的单核细胞：活动性结核病患者与潜伏性结核病患者，并统一接受 PPD 体外刺激。除上述信息外，关于具体基因数量、差异表达基因列表、统计阈值、样本重复数等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于 ebi.ac.uk，即 EBI Expression Atlas 平台。源站描述明确其物种为 Homo sapiens，样本为活动性或潜伏性结核病患者的单核细胞，并在体外经 PPD 刺激。该数据集以 E-MTAB-8162 为编号收录，属于 Expression Atlas 中的差异表达实验条目。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体实验操作流程等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于结核病免疫学相关研究，例如比较活动性与潜伏性结核感染中单核细胞对 PPD 刺激的转录响应差异，探索潜在的外周血表达标志物，或作为结核病宿主免疫应答研究的公共数据参考。由于其主题标签为差异表达，也可用于差异表达分析方法的比较与验证，以及感染 / 结核病分类下的数据整合研究。具体应用需结合源站提供的实验设计与分析结果进行判断。
【使用方法】
使用该数据集时，可通过 EBI Expression Atlas 平台检索编号 E-MTAB-8162 获取实验页面及差异表达结果。用户可依据源站提供的分组信息（活动性结核与潜伏性结核、PPD 刺激条件）理解比较结构，并结合 Expression Atlas 的差异表达展示方式进行基因层面的查询与解读。关于数据下载格式、分析流程参数、归一化方法等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 Expression Atlas 的差异表达实验框架，物种与样本信息明确，但关于样本量、重复数、统计显著性阈值、批次效应控制等质量相关细节，源站未提供。使用时应注意到活动性与潜伏性结核分组以及体外 PPD 刺激条件对结果解释的影响，相关实验设计细节需以源站记录为准。源站未提供其他质量评估信息。
【引用与许可】
该数据集收录于 EBI Expression Atlas，编号为 E-MTAB-8162。关于引用方式、原始文献、数据许可条款等，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前，应查阅源站页面获取最新的引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-8162
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Monocytes from people with active or latent TB stimulated in vitro with PPD
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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