死亡风险分层脓毒症血清抑制人诱导多能干细胞来源心肌细胞收缩力与线粒体功能 [SOMAscan]
该数据集来自 NCBI GEO,包含儿童脓毒症休克患者已储存血清的 aptamer 蛋白质组学数据(SOMAscan),按 PERSEVERE II 死亡概率分为低、中、高风险
![GSE314568: Mortality Risk-Stratified Septic Serum Depresses Contractility and Mitochondrial Function in Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes [SOMAscan]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/164856.jpg)
基本信息
资源简介
死亡风险分层脓毒症血清抑制人诱导多能干细胞来源心肌细胞收缩力与线粒体功能 [SOMAscan]
Mortality Risk-Stratified Septic Serum Depresses Contractility and Mitochondrial Function in Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes [SOMAscan]
该数据集来自 NCBI GEO,包含儿童脓毒症休克患者已储存血清的 aptamer 蛋白质组学数据(SOMAscan),按 PERSEVERE II 死亡概率分为低、中、高风险。数据可用于比较不同死亡风险组间血清蛋白表达差异,识别高风险相关差异蛋白(如 IL-6、IL-8),并为脓毒症休克心肌细胞病理生物学转化建模提供基础(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 19 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们试图界定按死亡风险分层的脓毒症血清中的蛋白质组差异,作为脓毒症休克心肌细胞病理生物学转化建模的前奏。先前储存的脓毒症休克儿童血清(n=120)按儿童脓毒症生物标志物风险模型(PERSEVERE)II 死亡概率分为低、中、高风险。我们进行了基于适配体的脓毒症血清蛋白质组分析,以确定高死亡风险与低死亡风险儿童中差异表达的蛋白质。被指定为 PERSEVERE II 高死亡风险的患者血清相对于低死亡风险患者表现出整体蛋白质组偏移,且 IL-6 和 IL-8 是高死亡概率儿童中显著差异表达的蛋白质。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Protein profiling by protein array、GPL36446、9606。本站分类:感染性疾病/脓毒症。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE314568
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 01 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在明确按死亡风险分层的脓毒症血清中的蛋白质组学差异,为脓毒性休克中心肌细胞病理生物学的转化建模奠定基础。此前储存的脓毒性休克患儿血清(n=120)根据儿童脓毒症生物标志物风险模型(PERSEVERE)II死亡概率分为低、中、高风险。我们对脓毒症血清进行了基于适配体的蛋白质组学分析,以确定高死亡风险与低死亡风险患儿之间差异表达的蛋白质。被判定为PERSEVERE II高死亡风险的患者血清相对于低死亡风险患者血清表现出整体蛋白质组学偏移,且IL-6和IL-8是高死亡概率患儿中显著差异表达的蛋白质。针对差异蛋白质表达的下游蛋白质组学分析侧重于比较PERSEVERE II高风险与低风险样本,并对研究中心、年龄和检测板进行了校正。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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