溶血性葡萄球菌脓毒症群体感应调控数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285447

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在许多病原体中，群体感应系统调控毒力。因此，群体感应常被提出作为抗毒力药物开发的靶点。凝固酶阴性葡萄球菌是医院获得性血液感染以及此类感染最严重后果——脓毒症所致死亡的主要原因。然而，对于毒力尤其是群体感应如何影响凝固酶阴性葡萄球菌脓毒症，目前严重缺乏了解。利用小鼠全身感染模型，我们在此表明，葡萄球菌Agr群体感应系统对由代表性凝固酶阴性葡萄球菌物种溶血性葡萄球菌引起的脓毒症死亡率具有强烈影响。为此，我们分析了溶血性葡萄球菌Agr的机制和调节子，揭示出群体感应调控强烈集中于酚溶性调节蛋白毒素。我们的结果进一步表明，PSMs几乎是Agr效应对溶血性葡萄球菌脓毒症影响的唯一介质，并提示其主要潜在机制是PSMs的细胞溶解能力。

这些发现表明，Agr和PSMs是开发针对凝固酶阴性葡萄球菌所致脓毒症的抗毒力药物的有前景的靶点。这与针对金黄色葡萄球菌血流感染的群体感应靶向策略形成对比——此类方法在该领域被认为前景较差。我们的结果表明，这种差异源于Agr调控在凝固酶阴性葡萄球菌中更为集中的作用：在毒素中，Agr唯独且异常紧密地调控PSMs。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。