微胶质细胞清除与非清除海马组织转录组分析

该数据集来自 NCBI GEO(GSE198861),聚焦脓毒症相关脑病过程中微胶质细胞的作用。研究比较了脓毒症诱导后微胶质细胞清除小鼠与非清除小鼠的海马组织转录组,采用高通量测序进行表达谱分析,平台为 GPL17021,物种为小鼠(10090)

geo
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基因组分类GPL1702110090
GSE198861: Transcriptome analysis of microglia depleted and non-depleted hippocampus tissue

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

微胶质细胞清除与非清除海马组织转录组分析

Transcriptome analysis of microglia depleted and non-depleted hippocampus tissue

该数据集来自 NCBI GEO(GSE198861),聚焦脓毒症相关脑病过程中微胶质细胞的作用。研究比较了脓毒症诱导后微胶质细胞清除小鼠与非清除小鼠的海马组织转录组,采用高通量测序进行表达谱分析,平台为 GPL17021,物种为小鼠(10090)。数据可用于探索微胶质细胞在脓毒症海马炎症反应中的调控作用,并支持差异表达与功能富集等分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):脓毒症相关脑病是全身性炎症期间常见的并发症。微胶质细胞是该过程中的关键参与者。为了更好地理解,我们比较了脓毒症诱导后微胶质细胞清除小鼠和非清除小鼠的海马组织。我们显示,在微胶质细胞清除动物的海马中,炎症反应总体减少。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL17021、10090。本站分类:感染性疾病/脓毒症。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE198861

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 10 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症相关脑病是全身性炎症过程中常见的并发症。小胶质细胞是这一过程中的关键参与者。为了更好地理解这一过程,我们比较了脓毒症诱导后小胶质细胞清除小鼠与未清除小鼠的海马组织。我们发现,在小胶质细胞清除动物的海马中,炎症反应总体减轻。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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