GSE168440:尿液细胞基因组生物标志物揭示脓毒症与无菌性炎症的独特代谢组差异(验证队列)

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE168440,是脓毒症与无菌性炎症鉴别研究的验证队列,包含 1 个文件 GSE168440_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及表达谱芯片、GPL17586 平台和人类 9606

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL175869606
GSE168440: Genomic biomarkers from urine cells indicate a unique metabolomic difference between sepsis and sterile inflammation (validation cohort)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

GSE168440:尿液细胞基因组生物标志物揭示脓毒症与无菌性炎症的独特代谢组差异(验证队列)

Genomic biomarkers from urine cells indicate a unique metabolomic difference between sepsis and sterile inflammation (validation cohort)

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE168440,是脓毒症与无菌性炎症鉴别研究的验证队列,包含 1 个文件 GSE168440_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及表达谱芯片、GPL17586 平台和人类 9606。源站描述指出,脓毒症由病原体引起的失调宿主反应驱动,而 SIRS 由组织损伤驱动,临床常难以区分;血液基因芯片已显示鉴别效力,但尿液脓毒症标志物的诊断价值未知。该研究利用尿液细胞开展单细胞相关分析,数据可用于探索脓毒症与无菌性炎症在尿液细胞基因组层面的差异,并支持分类模型构建(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 08 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):脓毒症是一种时间敏感性病症,伴随显著的死亡率、发病率与医疗成本,尤其在诊断延迟时。临床医生在因大手术造成无菌性组织损伤的患者中,常无法准确区分脓毒症与无菌性全身炎症反应综合征(SIRS)。脓毒症由宿主对病原体的失调反应驱动;SIRS 由组织损伤驱动。全血或血液特定细胞成分的转录组分析已被用于发现脓毒症与未感染 SIRS 之间的潜在病因学差异。基于血液的基因微阵列已证明在区分脓毒症与 SIRS 方面有效。危重患者常因标准临床护理而采集尿液,但尿液脓毒症生物标志物的诊断效用尚不清楚。在本研究中,我们使用单细胞……

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL17586、9606。本站分类:感染性疾病/脓毒症。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE168440

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 13 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症是一种具有时间敏感性的疾病,伴随显著的死亡率、发病率及医疗费用,尤其在诊断延迟时更为突出。临床医生在因大型手术导致无菌性组织损伤的患者中,往往难以准确区分脓毒症与无菌性全身炎症反应综合征(SIRS)。脓毒症由宿主对病原体反应失调所驱动;而SIRS则由组织损伤引起。全血或血液特定细胞成分的转录组学分析已被用于探索脓毒症与非感染性SIRS之间潜在的病因学差异。基于血液的基因微阵列已显示出在区分脓毒症与SIRS方面的有效性。重症患者常按标准临床护理收集尿液,但尿液脓毒症生物标志物的诊断价值尚不清楚。

在本研究中,我们使用了SIRS和脓毒症患者的单中心前瞻性队列,检验了以下假设:基于全基因组转录组尿液RNA特征的机器学习特征选择能够识别出在脓毒症发病十二小时内区分脓毒症与无菌性SIRS的基因表达模式。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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