GSE167914:有脓毒症风险患者外周单个核细胞代谢受损

该数据集来自 NCBI,标题为 GSE167914,聚焦有脓毒症风险患者外周单个核细胞的代谢受损。数据覆盖感染与脓毒症患者及健康对照的外周血,测量线粒体呼吸及与线粒体功能相关的基因表达

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基因组分类OtherGPL297839606
GSE167914: Impaired peripheral mononuclear cell metabolism in patients at risk of developing sepsis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

GSE167914:有脓毒症风险患者外周单个核细胞代谢受损

GSE167914 数据集来自 NCBI,标题为“Impaired peripheral mononuclear cell metabolism in patients at risk of developing sepsis”,聚焦有脓毒症风险患者外周单个核细胞的代谢受损问题。该数据集覆盖感染患者、脓毒症患者以及健康对照的外周血样本,测量线粒体呼吸以及与线粒体功能相关的基因表达,为研究脓毒症发生风险与外周单个核细胞代谢状态之间的关系提供了数据基础。数据集归类于感染性疾病 / 脓毒症方向,包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE167914_series_matrix.txt.gz,由 Velma、Herwanto 发布,发布时间为 Feb 28 202。

【数据集背景】

脓毒症是感染引发的严重全身性反应,早期识别高风险患者对临床干预具有重要意义。外周单个核细胞是外周血中参与免疫与炎症反应的重要细胞群体,其代谢状态,尤其是线粒体呼吸功能,与免疫细胞的功能发挥密切相关。该数据集围绕“有脓毒症风险患者外周单个核细胞代谢受损”这一主题,对感染患者、脓毒症患者及健康对照的外周血进行线粒体呼吸测量和线粒体功能相关基因表达检测,旨在从细胞代谢层面刻画脓毒症风险人群的生物学特征。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE167914_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。数据内容涵盖外周血样本的线粒体呼吸测量结果,以及与线粒体功能相关的基因表达信息;样本来源包括感染患者、脓毒症患者和健康对照三类。主题标签涉及 Other、GPL29783 和 9606,其中 9606 对应人类物种信息。数据集的具体样本数量、检测平台细节及基因列表等,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题与数据集英文名一致,均为“Impaired peripheral mononuclear cell metabolism in patients at risk of developing sepsis”。数据由 Velma、Herwanto 发布,发布时间为 Feb 28 202。样本采集自感染患者、脓毒症患者及健康对照的外周血,检测内容包括线粒体呼吸和线粒体功能相关基因表达。更详细的采集机构、伦理审批信息及临床样本纳入标准,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于感染性疾病与脓毒症方向的研究,可用于探索有脓毒症风险患者外周单个核细胞的代谢改变,比较感染患者、脓毒症患者与健康对照之间线粒体呼吸及线粒体功能相关基因表达的差异,也可作为脓毒症风险生物标志物或代谢机制研究的参考数据。此外,该数据可用于免疫细胞代谢与感染性疾病关系的验证性分析。具体分析场景需结合源站提供的完整信息确定。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE167914_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认数据结构和注释信息无误后,再进行批量接入与分析。由于该文件为系列矩阵格式,通常包含样本信息与表达测量值,分析前应明确样本分组与检测指标含义。更详细的处理流程与参数设置,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模与样本量信息源站未提供,使用前需自行核对数据完整性与字段一致性。数据集聚焦外周单个核细胞的线粒体呼吸与相关基因表达,未涵盖其他代谢通路或临床结局的完整信息。关于数据质量控制指标、缺失值情况、批次效应及验证结果,源站未提供。使用时应结合研究目的谨慎解释结果,避免超出数据覆盖范围的外推。

【引用与许可】

数据集来自 NCBI,发布者为 Velma、Herwanto,发布时间为 Feb 28 202。引用时应参考源站提供的正式引用信息与作者列表。关于数据使用许可、再分发条件及版权声明,源站未提供,使用前应查阅源站相关说明并遵守其规定。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167914

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

从感染和脓毒症患者以及健康对照者的外周血中,测定了线粒体呼吸以及与线粒体功能相关的基因表达。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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