早期脓毒症尿液分子特征发现与验证数据集

该数据集来自 NCBI GEO,标题为早期脓毒症尿液分子特征的发现与验证,属于感染性疾病/脓毒症方向。该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,可用于早期脓毒症尿液分子标志物的发现与验证研究,支撑基于表达谱的样本分类分析(来源 NCBI)

geo
浏览 3
基因组分类Expression profiling by arrayGPL175869606
GSE112100: Discovery and validation of urinary molecular signature of early sepsis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

早期脓毒症尿液分子特征发现与验证数据集

GSE112100 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,标题为“早期脓毒症尿液分子特征的发现与验证”(Discovery and validation of urinary molecular signature of early sepsis),归属于感染性疾病 / 脓毒症方向。该数据集以 SuperSeries 的形式组织,由若干 SubSeries 组成,围绕早期脓毒症的尿液分子标志物开展发现与验证工作,可用于基于表达谱的样本分类分析。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE112100_series_matrix.txt.gz,作者为 Azra、Bihorac,发布时间为 2019 年 3 月 20 日,主题标签涉及表达谱芯片分析、GPL17586 平台以及物种 9606(人类)。

【数据集背景】

脓毒症是感染引发的全身性反应,早期识别对临床处置具有重要意义。该数据集聚焦于早期脓毒症的尿液分子特征,试图通过尿液样本的分子层面检测来发现可用于早期识别的标志物,并在独立样本中加以验证。数据集标题明确体现了“发现”与“验证”两个环节,说明其设计目标不止于单一队列的探索性分析,而是包含对候选分子特征的确认过程。数据集所属分类为感染性疾病 / 脓毒症,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据内容】

该数据集为 SuperSeries,源站描述指出其由下列 SubSeries 组成,具体 SubSeries 的编号与内容源站未提供。数据集文件数量为 1,文件样例为 GSE112100_series_matrix.txt.gz,即压缩后的系列矩阵文件,通常承载样本层面的表达谱数据与样本注释信息。主题标签显示其数据类型为表达谱芯片分析(Expression profiling by array),涉及平台 GPL17586,物种为 9606(人类)。数据集内具体包含多少样本、覆盖多少基因或探针、分组构成如何,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),作者为 Azra、Bihorac,发布时间为 2019 年 3 月 20 日。数据以 SuperSeries 形式发布,源站描述仅说明其由若干 SubSeries 组成。样本采集的具体地点、时间跨度、纳入与排除标准、伦理审批信息以及尿液样本的处理流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于早期脓毒症尿液分子标志物的发现与验证研究,支撑基于表达谱的样本分类分析。典型用途包括:在表达谱层面比较不同样本组之间的分子差异,筛选候选标志物;利用数据集内的验证部分评估候选特征的重复性;以及作为感染性疾病 / 脓毒症方向的方法学比较或分析流程测试数据。由于数据集以尿液分子特征为主题,其适用分析应围绕表达谱数据展开。具体可支持的临床预测模型类型与性能水平,源站未提供。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE112100_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认样本注释、表达值格式与分组信息无误后,再批量接入完整数据。分析时应结合平台 GPL17586 的注释信息将探针映射到基因层面。若需追溯 SubSeries 层面的原始数据与处理细节,应进一步查阅源站对应条目;各 SubSeries 的具体构成,源站未提供。

【质量与限制】

数据集为 SuperSeries 结构,源站描述仅说明其由若干 SubSeries 组成,未提供样本量、批次信息、数据标准化方法及质控指标,因此难以仅凭现有信息评估其数据质量。文件数量为 1,意味着当前可见内容主要为系列矩阵文件,原始芯片数据与处理中间文件的情况源站未提供。使用中应注意 SuperSeries 与 SubSeries 之间的层级关系,避免重复计入样本。数据集发布时间为 2019 年 3 月 20 日,后续是否有更新版本,源站未提供。

【引用与许可】

数据来源为 NCBI GEO,使用时应引用数据集标题“Discovery and validation of urinary molecular signature of early sepsis”及作者 Azra、Bihorac,并注明 GEO 登录号 GSE112100。数据的具体许可条款与使用限制,源站未提供,使用前应查阅源站条目中的相关声明。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE112100

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案