早期脓毒症诱导ARDS患者中性粒细胞相关基因表达

该数据集来自 omicsdi.org,收录早期脓毒症诱导急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者中性粒细胞相关基因的表达数据,属于感染性疾病/脓毒症分类下的转录组学主题

omicsdi
浏览 10
基因组分类Transcriptomics
Expression of Neutrophil-related genes in patients with early sepsis-induced ARDS

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

早期脓毒症诱导ARDS患者中性粒细胞相关基因表达

该数据集英文名为 Expression of Neutrophil-related genes in patients with early sepsis-induced ARDS,来源于 omicsdi.org,在本站归入感染性疾病 / 脓毒症分类,主题标签为转录组学。数据集聚焦于早期脓毒症诱导急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者中性粒细胞相关基因的表达情况,属于转录组学范畴的临床研究数据。其源站描述表明,这是一项针对脓毒症及脓毒症相关 ARDS 危重患者的临床研究,采集患者入院后最初 24 小时内的全血 RNA,研究目标是确定在单纯脓毒症患者与脓毒症合并 ARDS 患者中,是否能够识别出具有生物学相关性且存在差异表达的基因。研究采用前瞻性观察性研究、病例队列设计。整体而言,该数据集为探索脓毒症向 ARDS 进展过程中中性粒细胞相关基因表达变化提供了转录组层面的观察材料。

【数据集背景】

脓毒症是危重患者中常见的严重感染性疾病,部分患者会进一步发展为急性呼吸窘迫综合征(ARDS),早期识别与区分单纯脓毒症和脓毒症合并 ARDS 对临床研究具有重要意义。该数据集所依托的研究正是围绕这一临床问题展开,关注早期脓毒症诱导 ARDS 患者中性粒细胞相关基因的表达特征。研究以危重患者为对象,通过全血 RNA 的转录组分析,考察单纯脓毒症患者与脓毒症合并 ARDS 患者之间是否存在具有生物学相关性的差异表达基因。数据集的主题标签为转录组学,本站分类为感染性疾病 / 脓毒症,体现了其在感染性疾病转录组研究中的定位。

【数据内容】

该数据集收录的是早期脓毒症诱导急性呼吸窘迫综合征患者中性粒细胞相关基因的表达数据,属于转录组学主题。源站描述指出,研究关注的是在单纯脓毒症患者与脓毒症合并 ARDS 患者中识别具有生物学相关性的差异表达基因。关于数据的具体样本量、基因数量、表达矩阵格式、分组明细及注释信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,该研究为前瞻性观察性研究,采用病例队列设计,研究对象为脓毒症及脓毒症相关 ARDS 的危重患者,全血 RNA 采集于患者入院后最初 24 小时内。关于采集中心数量、患者纳入与排除标准、测序平台或检测方法的具体细节,源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集可用于围绕早期脓毒症与脓毒症相关 ARDS 的转录组学研究,例如比较单纯脓毒症患者与脓毒症合并 ARDS 患者之间中性粒细胞相关基因的表达差异,探索具有生物学相关性的差异表达基因。其主题标签为转录组学,本站分类为感染性疾病 / 脓毒症,适合归入感染性疾病相关的基因表达分析场景。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件组织格式、分析流程或配套工具等信息。使用者需依据来源站 omicsdi.org 的说明获取与使用该数据。

【质量与限制】

源站描述表明该研究为前瞻性观察性研究、病例队列设计,全血 RNA 采集于入院后最初 24 小时内,这些信息构成了对该数据集来源设计的基本说明。关于样本量、数据完整性、批次效应、缺失值情况以及其他质量控制指标,源站未提供。该数据集聚焦于中性粒细胞相关基因的表达,其结论外推范围受研究设计与研究对象所限,源站未提供进一步的限制说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在引用或再利用该数据前,应查阅来源站 omicsdi.org 的相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-66890

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对入住后最初24小时内采集全血的脓毒症及脓毒症相关ARDS危重患者的临床研究。研究目的是确定是否识别出在单纯脓毒症患者和脓毒症合并ARDS患者中具有生物学相关性的差异表达基因。前瞻性观察性研究,病例队列设计。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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