PXD003718：Giardia lamblia 中 HA 标签蛋白的共免疫沉淀
利用已知且保守的内吞因子的共免疫沉淀研究了 Giardia lamblia 高度分化的内吞系统，由此发现了新的相关组分。这些结果被整合为该肠道寄生虫内吞通路的相互作用组
基本信息
资源简介
PXD003718：Giardia lamblia 中 HA 标签蛋白的共免疫沉淀
PXD003718 是一个围绕蓝氏贾第鞭毛虫（Giardia lamblia）内吞系统开展共免疫沉淀研究的蛋白质组学数据集。蓝氏贾第鞭毛虫是一种寄生于肠道的原虫，其内吞系统在进化上高度分化，与常见真核模式生物存在明显差异。该数据集通过共免疫沉淀方法，对已知且保守的内吞因子进行捕获，进而鉴定出与这些因子相关联的新组分，并将结果整合为该寄生虫内吞通路的相互作用组。数据集归属于感染 / 寄生虫病类别，来源于 ebi.ac.uk，主题涵盖共免疫沉淀、网格蛋白（clathrin）、内吞作用以及蓝氏贾第鞭毛虫，并与贾第虫病（Giardiasis，DOID:10718）相关。整体而言，该数据集为理解这一肠道寄生虫独特内吞机制的分子组成提供了蛋白质相互作用层面的资源。
【数据集背景】
蓝氏贾第鞭毛虫的致病与生存依赖于其对宿主肠道环境的适应，而内吞系统在营养摄取、膜蛋白周转及与宿主相互作用中具有重要功能。然而，该寄生虫的内吞系统在进化上高度分化，许多在典型真核生物中保守的机制在此可能呈现不同面貌。为解析这一特殊系统的分子架构，研究者以已知且保守的内吞因子为切入点，利用共免疫沉淀手段寻找与之协同作用的蛋白组分，从而在相互作用层面刻画该肠道寄生虫的内吞通路。该数据集正是这一研究思路下的产物，其分类归属于感染 / 寄生虫病，并与贾第虫病这一疾病背景相关联。
【数据内容】
该数据集的核心内容为蓝氏贾第鞭毛虫中基于共免疫沉淀的蛋白质相互作用信息。研究针对已知且保守的内吞因子开展共免疫沉淀，由此发现了新的相关组分，并将这些结果组装成该寄生虫内吞通路的相互作用组。主题标签涵盖共免疫沉淀、网格蛋白、内吞作用以及蓝氏贾第鞭毛虫，同时关联到贾第虫病（DOID:10718）。数据集英文名称为“PXD003718: Co-immunoprecipitation of HA-tagged proteins in Giardia lamblia”，表明实验涉及带有 HA 标签的蛋白的共免疫沉淀。除上述内容外，关于具体鉴定到的蛋白数量、相互作用对数、覆盖度等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。其实验基础为在蓝氏贾第鞭毛虫中对 HA 标签蛋白进行共免疫沉淀，研究对象聚焦于已知且保守的内吞因子，目的是揭示与这些因子相关的新组分。源站描述指出，该研究调查了蓝氏贾第鞭毛虫高度分化的内吞系统，并最终将结果整合为该肠道寄生虫内吞通路的相互作用组。关于样本制备、仪器平台、质谱参数、实验重复次数等具体采集信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与蓝氏贾第鞭毛虫内吞系统相关的蛋白质相互作用研究，可用于探讨网格蛋白及内吞因子在该寄生虫中的关联组分，也可为贾第虫病相关的基础研究提供分子层面的参考。由于数据集以相互作用组的形式呈现内吞通路，其潜在用途包括比较该寄生虫与典型真核生物在内吞机制上的差异，以及为后续功能验证提供候选相互作用线索。关于该数据集在其他具体场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以蛋白质组学数据形式提供，可通过来源站 ebi.ac.uk 获取。使用时可结合共免疫沉淀与 HA 标签蛋白的实验背景，理解所鉴定的相互作用组分。关于具体的数据格式、下载方式、检索接口、分析流程或配套工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于共免疫沉淀方法构建相互作用组，此类方法能够提示蛋白间的关联，但关于其假阳性控制、验证程度、定量可靠性等质量指标，源站未提供。此外，数据集仅针对蓝氏贾第鞭毛虫的内吞系统，其结论向其他物种或通路的推广需谨慎。关于样本量、重复性及统计阈值等限制性信息，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003718
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
通过共免疫沉淀已知且保守的内吞因子，研究了蓝氏贾第鞭毛虫分歧的内吞系统，进而发现了新的相关组件。这些组件被整合成该肠道寄生虫内吞途径的相互作用组。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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