基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1482585：克氏锥虫基因组噬菌体展示数据集用于恰加斯病大规模表位定位

该数据集为 NCBI BioProject 收录的克氏锥虫（Trypanosoma cruzi）基因组噬菌体（gPhage）展示数据集，面向恰加斯病的大规模表位定位研究。其英文名称为 PRJNA1482585: Trypanosoma cruzi Genomic Phage (gPhage) Display Dataset for Large-Scale Epitope Mapping in Chagas Disease，源站标题为 ID 1482585 - BioProject - NCBI，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。本站将其归类于感染 / 寄生虫病方向，主题标签为 Raw sequence reads。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录，这些数据来自单一组织或联合体，用户可通过该记录集中找到同一项目下产生的多种数据类型。该数据集即属于此类项目记录，围绕克氏锥虫基因组噬菌体展示技术，服务于恰加斯病相关的大规模表位定位研究。

【数据集背景】

克氏锥虫（Trypanosoma cruzi）是恰加斯病的病原体，恰加斯病属于寄生虫病范畴，在本站分类中归入感染 / 寄生虫病。该数据集以基因组噬菌体（gPhage）展示技术为核心，面向大规模表位定位研究。其 BioProject 记录来源于 NCBI，标题为 ID 1482585 - BioProject - NCBI。BioProject 作为生物数据集合，旨在为单一研究计划提供统一入口，使用户能够在一个记录中定位到由该计划产生的多种数据类型。该项目的设立与恰加斯病表位定位研究直接相关，主题标签为 Raw sequence reads，表明其数据形态以原始序列读长为主。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，即原始序列读长。数据集名称中包含“Genomic Phage (gPhage) Display Dataset”，说明其内容与基因组噬菌体展示相关，并用于大规模表位定位。数据集英文全称中同时出现“Trypanosoma cruzi”与“Chagas Disease”，表明其研究对象为克氏锥虫，研究目标指向恰加斯病。除上述信息外，源站未提供关于具体样本数量、序列条数、读长长度、覆盖度、表位数量或靶标列表等更细粒度的数据内容描述。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 ID 1482585 - BioProject - NCBI。其 BioProject 记录由单一组织或联合体发起，属于围绕单一研究计划汇集的数据集合。BioProject 记录的设计目的是让用户在一个位置找到该项目产生的多种数据类型。除来源站与 BioProject 标识外，源站未提供关于样本采集地点、采集时间、宿主信息、菌株或克隆信息、建库方法等具体采集细节。

【适用场景】

该数据集适用于恰加斯病相关的大规模表位定位研究，尤其是基于克氏锥虫基因组噬菌体展示技术的表位筛选与定位工作。由于主题标签为 Raw sequence reads，其原始序列读长可用于后续的序列分析、表位候选区域识别以及相关免疫学或寄生虫学研究。BioProject 记录本身也适合作为项目级入口，帮助用户查找同一研究计划下产生的多种数据类型。除上述方向外，源站未提供关于该数据集在其他具体场景中应用的说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录访问该数据集，源站标题为 ID 1482585 - BioProject - NCBI，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 记录提供单一入口，便于用户定位该项目下产生的多种数据类型。由于主题标签为 Raw sequence reads，使用者可预期获取原始序列读长数据并开展相应分析。除上述访问方式与数据形态外，源站未提供关于具体下载格式、分析流程、软件工具或参数设置的使用说明。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的项目记录，其数据围绕单一研究计划汇集，来源于单一组织或联合体。主题标签为 Raw sequence reads，表明数据以原始序列读长形式存在。除上述信息外，源站未提供关于数据质量评估、错误率、污染控制、重复性、验证实验或使用限制的具体说明。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 ID 1482585 - BioProject - NCBI，英文名称为 PRJNA1482585: Trypanosoma cruzi Genomic Phage (gPhage) Display Dataset for Large-Scale Epitope Mapping in Chagas Disease。除上述标识信息外，源站未提供关于引用格式、许可条款、使用授权或数据共享政策的具体内容。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1482585

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1482585

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集提供了使用基因组噬菌体（gPhage）展示平台生成的高通量测序数据。我们从真核寄生虫克氏锥虫（恰加斯病的病原体）的基因组中构建了一个全面的噬菌体展示肽库，以描绘和映射针对该寄生虫的全球人类抗体反应图谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别