GSE9880:微小牛蜱卵巢组织巴贝虫感染/对照 LongSAGE 文库
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,包含巴贝虫感染与对照的微小牛蜱卵巢组织所构建的 LongSAGE 文库,目的是寻找两个文库中的差异基因表达

基本信息
资源简介
GSE9880:微小牛蜱卵巢组织巴贝虫感染/对照 LongSAGE 文库
Babesia Infected/Control LongSAGE libraries for Boophilus microplus ovary tissue
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,包含巴贝虫感染与对照的微小牛蜱卵巢组织所构建的 LongSAGE 文库,目的是寻找两个文库中的差异基因表达。数据规模为 1 个文件,样例文件为 GSE9880_series_matrix.txt.gz,作者为 Felix,D,Guerrero,发布时间为 Dec 13 200。主题标签涉及 Expression profiling by SAGE、GPL6274 与 6941。该数据可用于感染与寄生虫病方向下基于 SAGE 的表达谱分析,支持对感染与对照条件下基因表达差异的识别与比较研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Dec 13 200。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):使用巴贝虫感染(及对照)的卵巢组织构建 LongSAGE 文库。目的是在两个文库中寻找差异基因表达。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by SAGE、GPL6274、6941。本站分类:感染/寄生虫病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE9880
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 17 201,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
使用巴贝虫感染(及对照)卵巢组织构建了LongSAGE文库,旨在发现两个文库中的差异基因表达。详情:提取使用Ambion的ToTALLY RNA试剂盒,串联体构建使用Invitrogen的I-SAGE Long试剂盒。串联体文件(多个fasta序列文件)通过内部Perl脚本处理,以提取17bp的LongSAGE标签。**注:联系人:Felix D. Guerrero。邮箱:felix.guerrero@ars.usda.gov 关键词:LongSAGE
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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