弓形虫eIF5A K49突变体碱性应激分化单细胞转录组图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE346252

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨真核翻译起始因子5A（eIF5A）中赖氨酸49（K49）的乙酰化状态如何影响刚地弓形虫的转录异质性和发育状态转换。以ME49株为遗传背景，我们对野生型寄生虫、eIF5A-K49Q乙酰化模拟突变体以及eIF5A-K49R不可乙酰化电荷保守突变体进行了10x Genomics单细胞RNA测序。每种寄生虫株均在标准条件下培养，或暴露于碱性培养基（pH 8.2，持续4天）以在体外诱导速殖子向缓殖子分化。对于每个基因型-条件组合，在单细胞捕获前将三个独立培养的生物学重复混合，以生成一个scRNA-seq文库。共生成六个混合文库。该数据集可用于表征寄生虫细胞状态异质性以及与应激诱导分化过程中eIF5A K49状态相关的转录程序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。