GSE43784：弓形虫分裂所需的核仁AAA-NTPase

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE43784

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

刚地弓形虫细胞周期突变体11-104A4可逆地阻滞于G1期。通过遗传互补将该突变体的缺陷定位到一个编码新型AAA-ATPase/CDC48家族成员（TgNoAP1）的基因。AAA+结构域上游的酪氨酸变为半胱氨酸导致蛋白质不稳定，并引起细胞周期阻滞。该因子受细胞周期调控，并在G1/S期专一性地表达于核仁中。在高温下，该突变体迅速阻滞于单核状态，并表达富集于G1亚转录组的转录本。这一独特的CDC48直系同源物参与寄生虫中负责G1期进展的机制，是弓形虫中描述的首个G1期特异性检查点因子。我们描述了温度敏感突变体11-104A4的转录组。转录组研究表明，基因表达反映了寄生虫在G1期的阻滞。通常在S/M期上调的mRNA在限制性温度40℃下在突变体中大幅下调。用野生型TgNoAP1的额外拷贝进行遗传互补可挽救突变体11-104A4在40℃下的生长，并逆转转录组的变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。