GSE339042：Giardia滋养体在甲硝唑、氧气或铁缺乏条件下的RNA-Seq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE339042

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

蓝氏贾第鞭毛虫是一种微需氧原生动物寄生虫，每年感染全球近2.8亿人，是腹泻病的主要病因之一。其线粒体相关细胞器（MROs）缺乏基因组、嵴和氧化磷酸化酶，但保留了铁硫簇（ISC）生物合成等基本功能。为确定GlMitoCarta蛋白质组在关键药物和环境扰动下重塑的程度，我们将贾第鞭毛虫滋养体暴露于甲硝唑（MTZ，贾第虫病的首选治疗药物），以及铁缺乏和氧气（O₂）暴露条件下，并分析了由此产生的转录反应。该数据集展示了这些条件下贾第鞭毛虫滋养体的基于RNA-seq的转录组分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。