GSE210644：转录组模块-表型关联研究提示胞外囊泡生物发生在恶性疟原虫青蒿素耐药中的作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE210644

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞外囊泡在恶性疟原虫青蒿素耐药性发展中的作用尚不清楚。我们提出了细胞外囊泡在ARTr发展中的作用（细胞外囊泡输出假说）（Tandoh等，2022）。本研究的目的是检验细胞外囊泡输出假说的一项预测，以深入了解细胞外囊泡在青蒿素耐药表型表达中的推定作用。我们采用基因集富集分析，比较了两种青蒿素耐药寄生虫（C580R和R539T）与一种青蒿素敏感寄生虫（Dd2）的基因表达谱，以评估感兴趣细胞外囊泡模块的富集情况；其中，两种耐药寄生虫是通过基于CRISPR的编辑技术对青蒿素敏感寄生虫（Dd2）进行编辑而产生的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。