E-GEOD-33601:局部皮肤利什曼病与黏膜利什曼病患者原发性皮肤病灶的人类转录组模式

数据内容为局部皮肤利什曼病与黏膜利什曼病患者原发性皮肤病灶的人类转录组模式,可用于比较两类利什曼病患者皮肤病灶的基因表达差异,支持感染与寄生虫病相关的转录组差异分析研究(来源 ebi.ac.uk)

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基因组分类Differential
E-GEOD-33601: Human transcriptome pattern of primary cutaneous lesions from patients with localized cutaneous leishmaniasis and mucosal leishmaniasis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

E-GEOD-33601:局部皮肤利什曼病与黏膜利什曼病患者原发性皮肤病灶的人类转录组模式

E-GEOD-33601 是一项关于人类转录组模式的研究数据集,全称为“Human transcriptome pattern of primary cutaneous lesions from patients with localized cutaneous leishmaniasis and mucosal leishmaniasis”。该数据集聚焦于局部皮肤利什曼病与黏膜利什曼病患者原发性皮肤病灶中的人类基因表达特征,属于感染与寄生虫病领域。其核心价值在于为比较两类利什曼病患者皮肤病灶之间的基因表达差异提供转录组层面的数据支持,有助于理解宿主在不同临床表现下的分子响应模式。数据集来源于 ebi.ac.uk,被归类为表达图谱实验中的差异表达类型,主题标签为“Differential”。

【数据集背景】

利什曼病是一类由利什曼原虫引起的寄生虫病,临床表现多样,其中局部皮肤利什曼病和黏膜利什曼病是两种重要的疾病形式。两者在病灶部位、病程进展和免疫应答方面存在差异,但其宿主转录组层面的差异尚需通过系统性的基因表达数据加以刻画。E-GEOD-33601 正是在这一背景下产生,旨在通过人类转录组模式来反映两类患者原发性皮肤病灶的基因表达状态。该数据集属于感染 / 寄生虫病分类,来源于 ebi.ac.uk,是 Expression Atlas 中的一项差异表达实验。

【数据内容】

该数据集的内容为局部皮肤利什曼病与黏膜利什曼病患者原发性皮肤病灶的人类转录组模式。具体而言,它记录了来自这两类患者皮肤病灶样本的人类基因表达信息,可用于比较两类利什曼病患者皮肤病灶之间的基因表达差异。数据集的主题标签为“Differential”,表明其设计目的侧重于差异表达分析。物种为 Homo sapiens。除上述信息外,关于样本数量、基因数量、具体差异表达基因列表等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,是 Expression Atlas 中的一项实验记录,实验类型为 Differential。其源站描述为:“Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Human transcriptome pattern of primary cutaneous lesions from patients with localized cutaneous leishmaniasis and mucosal leishmaniasis”。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息以及实验操作流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于感染与寄生虫病相关的转录组差异分析研究,尤其是针对局部皮肤利什曼病与黏膜利什曼病之间皮肤病灶基因表达差异的比较研究。研究人员可以利用该数据集探索两类利什曼病患者在原发性皮肤病灶中的人类转录组模式差异,进而支持宿主免疫反应、疾病进展机制或潜在生物标志物等方面的分析。此外,该数据集也可用于差异表达分析方法的验证或作为相关研究的参考数据。但需注意,其适用性应结合具体研究问题和数据质量进行评估。

【使用方法】

该数据集可通过 ebi.ac.uk 获取,具体访问方式、下载格式、数据处理流程及分析工具等,源站未提供。用户在使用时应当参考 Expression Atlas 平台的一般使用规范,并结合差异表达实验的特点进行数据解读。由于源站未提供详细的使用说明,建议用户直接访问来源站点获取最新信息。

【质量与限制】

该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas,属于差异表达实验。关于数据质量评估指标、样本量、批次效应、技术重复、生物学重复以及数据完整性等信息,源站未提供。因此,在使用该数据集时,用户应自行评估其适用性和可靠性。此外,该数据集仅涉及人类转录组模式,不包含利什曼原虫的转录组信息,因此无法直接用于寄生虫本身的基因表达分析。对于临床元数据、患者特征等详细信息,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及版权信息等,源站未提供。用户在使用该数据集时,应直接访问 ebi.ac.uk 查看相关说明,并遵循来源站点的引用和许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-33601

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Human transcriptome pattern of primary cutaneous lesions from patients with localized cutaneous leishmaniasis and mucosal leishmaniasis

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