PXD000706：嗜肺军团菌效应蛋白PieE的相互作用组
该数据集来自 ebi.ac.uk，主题为嗜肺军团菌效应蛋白 PieE 的体内相互作用组，源站描述指出 PieE 可与多种 Rab GTPases 结合
基本信息
资源简介
PXD000706：嗜肺军团菌效应蛋白PieE的相互作用组
PXD000706 数据集聚焦于嗜肺军团菌（Legionella pneumophila）效应蛋白 PieE 的体内相互作用组研究。嗜肺军团菌是引起军团菌病（Legionellosis）的病原体，其通过分泌效应蛋白干扰宿主细胞过程。该数据集由 ebi.ac.uk 提供，源站描述指出，PieE 的体内相互作用组分析揭示了其与多种 Rab GTPases 的结合。数据集归类于感染 / 感染性疾病方向，主题标签涵盖嗜肺军团菌及军团菌病。整体而言，该数据集为研究 PieE 效应蛋白在感染过程中与宿主 Rab GTPase 家族的相互作用提供了数据基础，可供从事病原体—宿主相互作用、细菌效应蛋白功能及军团菌致病机制研究的科研人员参考使用。
【数据集背景】
嗜肺军团菌是一种重要的胞内病原体，可引发军团菌病。该菌通过分泌多种效应蛋白进入宿主细胞，调控宿主细胞内的膜运输、信号转导等过程，从而建立有利于自身生存的胞内环境。PieE 是嗜肺军团菌的一种效应蛋白，其功能与宿主细胞内的相互作用网络密切相关。源站描述明确指出，PieE 的体内相互作用组研究揭示了其与多种 Rab GTPases 的结合，提示 PieE 可能通过靶向 Rab GTPase 家族影响宿主细胞的膜运输过程。该数据集即围绕这一相互作用组研究而建立，主题标签同时标注了嗜肺军团菌与军团菌病，表明其研究背景与军团菌感染性疾病直接相关。
【数据内容】
该数据集的主题为嗜肺军团菌效应蛋白 PieE 的体内相互作用组。根据源站描述，其核心内容涉及 PieE 在体内条件下与多种 Rab GTPases 的结合关系。数据集英文名称为“PXD000706: Interactome of the Legionella pneumophila effector PieE”，表明其属于蛋白质相互作用组学数据。主题标签涵盖嗜肺军团菌、军团菌病以及嗜肺军团菌相关分类条目。除上述信息外，关于数据集中具体包含的样本数量、鉴定到的相互作用蛋白数目、实验重复次数、质谱原始文件数量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述说明其研究内容为 PieE 的体内相互作用组，并指出该相互作用组分析揭示了 PieE 与多种 Rab GTPases 的结合。关于具体的实验材料、宿主细胞类型、样品制备流程、质谱采集参数、数据处理软件及版本等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于嗜肺军团菌效应蛋白 PieE 与宿主 Rab GTPase 相互作用的研究场景，可用于探讨 PieE 在军团菌感染过程中对宿主膜运输调控的潜在作用。其主题标签涉及军团菌病，因此也可作为感染性疾病相关病原体—宿主相互作用研究的参考数据。关于该数据集在其他具体研究场景（如药物靶点筛选、比较蛋白质组学分析等）中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式说明、分析流程或配套工具等信息。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息，包括数据完整性、重复性、鉴定置信度等指标。该数据集基于体内相互作用组研究，源站描述仅指出 PieE 与多种 Rab GTPases 结合，关于相互作用的具体验证程度、假阳性控制策略及数据覆盖范围等限制性信息，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式及许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000706
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
The in vivo interactome of the Legionella pneumophila effector PieE reveals binding to multiple Rab GTPases
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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