胞内病原菌嗜肺军团菌代谢效应因子活性多样机制数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.kj666

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 93.3 MB。

数据说明

病原体在感染过程中向宿主细胞输送复杂的转运效应蛋白库，但这些蛋白一旦进入真核细胞后受到何种程度的调控，目前仍不明确。在所有细菌病原体中，嗜肺军团菌拥有已知最大的转运底物集合，通过其IVB型Icm/Dot转运系统向宿主细胞输送超过300种蛋白。基于嗜肺军团菌中少数值得注意的效应器-效应器调控实例，我们试图通过对效应器-效应器功能性相互作用的系统性分析来界定这一现象的广度。我们利用酿酒酵母——一种已被确立的真核宿主替代模型——来探究约330种嗜肺军团菌转运底物的两个兼容表达文库之间的超过108,000对遗传相互作用。在捕获所有已知效应器-效应器抑制实例的同时，我们鉴定出十四种新型转运底物能够抑制其他细菌效应器的活性，以及一对具有协同作用的底物。

至少有九例中，这种调控是直接的——这是一类新兴蛋白质的标志，这类蛋白质被称为元效应蛋白，即“效应蛋白的效应蛋白”。通过详细的结构与功能分析，我们展示了元效应蛋白活性源自多种多样的机制，塑造了进化过程，并可用于揭示每种同源效应蛋白功能的重要方面。元效应蛋白，连同其他间接形式的效应蛋白–效应蛋白调节，可能是许多胞内病原体的共同特征——其潜力尚未被充分认识，有望帮助我们理解病原体如何调控其与宿主细胞的相互作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。