PRJNA1380982：通过遗传分析理解蚊虫移动及其防控相关性
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，包含在新加坡连续两个野外季节采集的超过 5000 只 Aedes aegypti 蚊虫的双酶切限制性位点关联 DNA 测序（ddRADseq）数据
基本信息
资源简介
PRJNA1380982：通过遗传分析理解蚊虫移动及其防控相关性
PRJNA1380982 数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads），在本站归入感染 / 感染性疾病分类。该数据集的核心内容是双酶切限制性位点关联 DNA 测序（ddRADseq）数据，测序对象为在新加坡连续两个野外季节采集的超过 5000 只埃及伊蚊（Aedes aegypti）。这批数据产生于一项群体基因组学与亲缘关系标记重捕（close-kin mark-recapture，CKMR）研究，研究目标在于刻画蚊虫的扩散行为与种群统计参数。整体而言，该数据集以高通量测序读段的形式，记录了大规模野外蚊虫样本的基因组变异信息，可用于蚊虫移动规律及其与防控相关问题的分析。
【数据集背景】
该数据集对应的项目名称为“Understanding mosquito movement and its relevance to control through genetic analysis”，即通过遗传分析理解蚊虫移动及其与防控的相关性。项目围绕蚊虫扩散这一在蚊媒传染病防控中具有关键意义的问题展开，采用群体基因组学与亲缘关系标记重捕（CKMR）相结合的研究思路，旨在刻画蚊虫的扩散过程与种群统计参数。数据在新加坡连续两个野外季节的采样基础上产生，体现了在真实野外条件下对蚊虫种群进行遗传学追踪的研究设计。
【数据内容】
数据集的内容为双酶切限制性位点关联 DNA 测序（ddRADseq）数据，属于原始测序读段类型。ddRADseq 是一种简化基因组测序策略，通过在基因组特定位点进行酶切并测序两侧片段，获得覆盖全基因组范围的大量标记位点，适合在群体水平上开展遗传变异与亲缘关系分析。该数据集覆盖超过 5000 只埃及伊蚊个体，样本规模较大，能够支撑群体遗传结构、个体间亲缘关系以及基于亲缘关系的重捕分析等研究需求。
【采集与来源】
样本采集地点为新加坡，采集时间跨越连续两个野外季节，采集对象为埃及伊蚊，累计超过 5000 只。数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。除上述采集地点、采集季节跨度、物种与样本数量信息外，源站未提供更细化的采集点分布、具体采集时间、样本处理流程等信息。
【适用场景】
基于其研究设计与数据类型，该数据集适用于蚊虫扩散行为与种群统计参数的相关分析，包括群体基因组学层面的遗传变异与分化研究，以及基于亲缘关系标记重捕（CKMR）框架的个体亲缘关系识别与扩散距离推断。由于研究对象为埃及伊蚊，相关分析可用于探讨蚊虫移动规律与蚊媒防控策略之间的关系。除上述由项目描述所指向的用途外，源站未提供其他具体应用场景的说明。
【使用方法】
该数据集以原始测序读段形式提供，使用时可按照 ddRADseq 数据的常规分析流程进行处理，包括读段质控、酶切位点相关序列的识别与标记构建、基因型判定，以及后续的群体遗传学与亲缘关系分析。源站未提供针对该数据集的具体分析流程、参数设置或配套代码说明。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估指标、测序深度、缺失率、过滤标准等质量相关信息，也未提供其局限性说明。使用时需注意，数据仅覆盖新加坡地区连续两个野外季节采集的埃及伊蚊样本，源站未说明其可外推至其他地区或其他蚊种的程度。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1380982
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目包含双酶切限制性位点相关DNA测序（ddRADseq）数据，这些数据来自连续两个野外季节在新加坡采集的5000多只埃及伊蚊。该数据集是一项群体基因组学和近亲标记重捕（CKMR）研究的一部分，旨在表征蚊子的扩散和种群统计参数。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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