E-GEOD-69597：布鲁氏菌病、利什曼病与健康对照血液 RNA-seq

资源简介

E-GEOD-69597：布鲁氏菌病、利什曼病与健康对照血液 RNA-seq

E-GEOD-69597 是一项来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集，物种为 Homo sapiens，聚焦于感染性疾病相关的血液转录组研究。该数据集收录了 105 例布鲁氏菌病患者、17 例利什曼病患者以及 47 例健康对照的血液 RNA-seq 数据，可用于比较不同感染状态与健康状态之间的基因表达差异。数据集在分类上归属于感染 / 感染性疾病，主题标签为 Differential，表明其核心用途在于差异表达分析。整体而言，该数据集为研究布鲁氏菌病和利什曼病这两种感染性疾病在外周血中的转录组特征提供了样本层面的数据基础，适合开展病例组与健康对照组之间的表达谱比较研究。

【数据集背景】

该数据集属于感染性疾病研究领域，来源站为 ebi.ac.uk，是 Expression Atlas 中的一项差异表达实验。Expression Atlas 是 EBI 提供的基因表达数据资源，用于汇集和展示不同实验条件下的表达信息。本实验以人类血液为研究对象，围绕布鲁氏菌病和利什曼病两种感染性疾病展开。布鲁氏菌病和利什曼病均属于感染性疾病范畴，前者由布鲁氏菌属细菌引起，后者由利什曼原虫引起。该数据集通过 RNA-seq 技术获取血液样本中的转录组信息，并以差异表达为实验主题，旨在支持对感染状态下基因表达变化的分析。

【数据内容】

数据集包含三类样本：105 例布鲁氏菌病患者、17 例利什曼病患者和 47 例健康对照，全部为血液 RNA-seq 数据。样本总数为 169 例。数据内容围绕人类血液样本的基因表达测量结果展开，实验类型为差异表达实验。主题标签为 Differential，说明该数据集的主要数据产出形式是比较不同组别之间的基因表达差异。物种信息明确为 Homo sapiens。除上述样本数量、样本类型、物种和实验主题外，源站未提供更多关于测序平台、读长、表达矩阵结构或具体基因层面的信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk，即 EBI Expression Atlas 中的一项实验记录，实验编号为 E-GEOD-69597。源站描述表明，该实验为 Expression Atlas experiment (Differential)，物种为 Homo sapiens，数据内容为来自 105 例布鲁氏菌病患者、17 例利什曼病患者和 47 例健康对照的血液 RNA-seq。除来源站和源站描述外，源站未提供关于样本采集地点、采集时间、伦理审批、受试者纳入排除标准等更多信息。

【适用场景】

该数据集适用于感染性疾病相关的转录组差异表达研究，尤其是针对布鲁氏菌病和利什曼病的血液表达谱比较分析。研究人员可利用该数据集比较患者组与健康对照组之间的基因表达差异，也可在两种感染性疾病之间进行表达特征的对照分析。由于数据来源于人类血液 RNA-seq，其适用场景还包括外周血转录组标志物探索、感染状态下的宿主基因表达响应研究，以及差异表达分析方法的验证与比较。该数据集的主题标签为 Differential，进一步表明其适合用于差异表达相关的分析任务。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 获取。作为一项差异表达实验，其典型使用方式包括下载表达数据并进行组间比较分析，例如布鲁氏菌病组与健康对照组、利什曼病组与健康对照组，或患者组之间的差异表达分析。使用者可根据研究目的选择相应的样本分组，并结合差异表达分析流程进行数据处理。除来源站和实验类型外，源站未提供关于具体下载格式、分析工具、标准化方法或推荐流程的更多信息。

【质量与限制】

该数据集包含 105 例布鲁氏菌病患者、17 例利什曼病患者和 47 例健康对照，样本数量在组间并不均衡，利什曼病组的样本量相对较少。该数据集为血液 RNA-seq 差异表达实验，物种为 Homo sapiens，来源站为 ebi.ac.uk。除上述信息外，源站未提供关于数据质量评估、批次效应、测序深度、覆盖度、缺失值处理或潜在混杂因素的信息。因此，在使用该数据集时，应结合源站提供的原始记录进一步确认数据质量与适用范围。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas，实验编号为 E-GEOD-69597。除来源站和实验编号外，源站未提供关于引用方式、许可协议、使用限制或授权条款的具体信息。使用者应参考来源站页面获取相应的引用与许可要求。