协调统一的跨中心微生物 MALDI-TOF 质谱与抗菌药物敏感性标签语料库

该数据集整合了七个独立公开发布的微生物 MALDI-TOF 质谱沉积数据,并附带抗菌药物敏感性标签,来源涵盖 CC0、CC-BY 及 RKI 等不同许可条件的谱图

ZenodoZenodo
zenodo
2026-01-01 更新
浏览 6
文本分类MALDI-TOFmass spectrometryclinical microbiologyantimicrobial susceptibilityantimicrobial resistancemicrobial identificationmachine learningdomain shift
A harmonised multicentre corpus of microbial MALDI-TOF spectra and antimicrobial susceptibility labels

基本信息

模态
文本
大小
36.813595699 GB
任务类型
分类
许可
Multiple licences
创建/更新时间
2026-01-01
版本
v1.0

资源简介

协调统一的跨中心微生物 MALDI-TOF 质谱与抗菌药物敏感性标签语料库

A harmonised multicentre corpus of microbial MALDI-TOF spectra and antimicrobial susceptibility labels

该数据集整合了七个独立公开发布的微生物 MALDI-TOF 质谱沉积数据,并附带抗菌药物敏感性标签,来源涵盖 CC0、CC-BY 及 RKI 等不同许可条件的谱图。数据可用于微生物鉴定、抗菌药物敏感性预测与耐药性分析,也适合作为机器学习研究中的跨中心域偏移评估资源。使用时需注意各来源谱图的许可条款差异,尤其是 RKI 衍生谱图暂按 CC-BY-NC-4.0 限制为非商业用途(来源 DOI 解析,Multiple licences 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):许可声明:本记录包含采用不同许可的组成部分。请在复用前审阅适用条款。本数据集协调统一了七个独立公开发布的沉积数据。来源衍生的谱图仍受其各自许可条款约束。以下目录路径指解包后的发布版本。CC0 与 CC BY 谱图——spectra/CC0_CC-BY_sources/源自以 CC0-1.0 或 CC-BY-4.0 发布的沉积数据。每个来源的适用许可记录于 LICENSES.csv。Robert Koch Institute 谱图——spectra/RKI_CC-BY-NC/RKI 数据描述文件指定 CC-BY-NC-4.0,而来源沉积数据的 Zenodo 许可元数据声明为 CC-BY-4.0。在澄清之前,本发布版本对 RKI 衍生谱图采用更严格的 CC-BY-NC-4.0 条款(仅限非商业使用)。两种声明及未解决的许可差异均记录于 LICENSES.cs

【主题与分类】

主题标签:MALDI-TOF、mass spectrometry、clinical microbiology、antimicrobial susceptibility、antimicrobial resistance、microbial identification、machine learning、domain shift。本站分类:感染/感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22993441

使用许可:Multiple licences。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22993441

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 36.81 GB。

数据说明

许可声明:本记录包含采用不同许可协议的组成部分。在重复使用前,请查阅适用的条款。本数据集整合了七个独立发布的公共数据存储库。源自这些存储库的光谱仍受其各自许可条款的约束。以下目录路径指向解压后的发布版本。CC0 和 CC BY 光谱——spectra/CC0_CC-BY_sources/ 源自以 CC0-1.0 或 CC-BY-4.0 许可发布的数据存储库。每个来源适用的许可记录在 LICENSES.csv 中。Robert Koch Institute 光谱——spectra/RKI_CC-BY-NC/ RKI 数据描述文件指定为 CC-BY-NC-4.0,而源数据存储库的 Zenodo 许可元数据声明为 CC-BY-4.0。在澄清之前,本发布版本对 RKI 衍生光谱采用限制更严格的 CC-BY-NC-4.0 条款(仅限非商业使用)。两种声明以及未解决的许可差异均记录在 LICENSES.csv 中。该子集包含 11,055 条光谱(占语料库的 1.88%)。需要不受非商业限制的光谱数据的用户应排除此目录。

汇编材料 — CC-BY-4.0 汇编元数据、模式、数据字典、分类学与抗生素映射、质量控制注释、分区定义及文档均依据 CC-BY-4.0 许可发布。该许可不取代管辖来源衍生谱图的条款。协调软件 — BSD-3-Clause 协调流程单独依据 BSD-3-Clause 软件许可存档。各组件具体许可详情请参阅 LICENSE_SUMMARY.md。引用本汇编及您所使用的来源存储库时,请遵循 SOURCE_ATTRIBUTION.md 中的指引。下载并重建 CC0/CC-BY 存档 CC0/CC-BY 谱图存档分两部分分发。请将以下四个文件下载至同一文件夹,并保持文件名不变:CC0_CC-BY_sources.tar.gz.part1-of-2 CC0_CC-BY_sources.tar.gz.part2-of-2 CC0_CC-BY_sources.two-pa

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案