Serratia marcescens 塑造两栖动物皮肤细菌群落并影响宿主存活

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A3a1e2c5f7bf8452bbfc101a599a6404deda0944b878e46ed49629c5e99b73296

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对微生物群落与其相关宿主之间功能相互作用的认识不断变化，正在影响人们对疾病的认知和改善方式。在众多宿主-微生物组-疾病研究系统中，无尾目动物中壶菌病的出现（由Batrachochytrium dendrobatidis引起，以下简称Bd）已被认为与全球两栖动物持续衰退和灭绝事件有关。有趣的是，两栖动物在抵抗Bd感染及后续疾病方面存在差异性存活。被认为有助于这种抵抗力的一个因素是宿主相关的皮肤微生物群。这引发了利用转基因益生菌重构宿主相关微生物群以实现所需抗真菌效果的可能性。在此，我们利用先前描述的一株粘质沙雷菌（Serratia marcescens，Sm）来操控两栖动物皮肤微生物群。Sm经过遗传改造，使其产生……的途径功能失调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。