PRJNA663629：化脓性链球菌与雅司病流行岛屿儿童特发性皮肤溃疡相关 2

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA663629

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在热带地区，儿童感染性皮肤溃疡中有三分之二由梅毒螺旋体亚种pertenue和杜克雷嗜血杆菌引起；其余溃疡的病因尚不清楚。为确定皮肤溃疡的其他病因，我们从巴布亚新几内亚的溃疡样本及健康儿童皮肤中采集了DNA。我们根据溃疡中是否存在梅毒螺旋体和杜克雷嗜血杆菌将溃疡分组，并对样本中的细菌16S rRNA基因进行了测序。我们发现，化脓性链球菌与不含梅毒螺旋体和杜克雷嗜血杆菌的皮肤溃疡以及抗生素治疗失败的溃疡相关。我们的研究应能改进对这种儿童痛苦且致衰弱疾病的诊断检测和治疗。*本提交包含随访溃疡、其环境对照及阴性对照的数据。溃疡、无症状对照及其各自的环境对照属于题为“Streptococcus pyogenes is Associated with Idiopathic Cutaneous Ulcers in Children on a Yaws-Endemic Island 1”的项目，因为完整数据集超出了NCBI样本提交限制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。