PRJNA1542216：小鼠体内R2 AAV衣壳文库的转录本测序
该数据集来自NCBI，为小鼠体内R2 AAV衣壳文库的转录本测序原始序列数据。R2文库带有侧翼简并条形码（fdBC），可对单个衣壳变体进行冗余条形码评估
基本信息
资源简介
PRJNA1542216：小鼠体内R2 AAV衣壳文库的转录本测序
该数据集来自NCBI，为小鼠体内R2 AAV衣壳文库的转录本测序原始序列数据。R2文库带有侧翼简并条形码（fdBC），可对单个衣壳变体进行冗余条形码评估。数据涵盖小鼠组织在CAPTURE富集或不富集条件下回收的病毒转录本，经下一代测序获得，可用于评估fdBC回收、随机信号丢失及文库来源转录本信号在各组织中的代表性，并借助文库中嵌入的遗传可区分野生型AAV9对照，评估不同给药剂量下的转录本信号回收情况（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究评估了靶向病毒转录本富集用于小鼠体内腺相关病毒（AAV）衣壳文库定量筛选的效果。R2文库整合了侧翼简并条形码（fdBC），可对单个衣壳变体进行基于冗余条形码的评估。体内给药后，从有或无CAPTURE富集的小鼠组织中回收文库来源的病毒转录本，并通过下一代测序进行分析。所得数据用于评估fdBC回收、随机信号丢失以及文库来源转录本信号在各组织中的代表性。文库中嵌入的遗传可区分野生型AAV9对照也用于评估在一系列给药剂量下转录本信号的回收情况。该数据集支持评估靶向病毒转录本富集以改善m
【主题与分类】
主题标签：Raw sequence reads。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1542216
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1542216
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究评估了靶向病毒转录本富集技术，用于在小鼠体内对腺相关病毒（AAV）衣壳文库进行定量体内筛选。R2文库引入了侧翼简并条形码（fdBCs），以实现基于冗余条形码的单个衣壳变异体评估。体内给药后，从有或无CAPTURE富集的小鼠组织中回收文库来源的病毒转录本，并通过下一代测序进行分析。所得数据用于评估fdBC回收率、随机信号丢失以及文库来源转录本信号在各组织中的代表性。文库中嵌入的遗传上可区分的野生型AAV9对照也用于评估在一系列给药剂量下转录本信号的回收情况。该数据集支持评估靶向病毒转录本富集技术在基于转录本的体内AAV衣壳筛选中改善分子采样和定量分析的效果。
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