80日龄Hycole兔高脂饮食肠道菌群16S rRNA测序数据集
数据以原始序列读长形式提供,可用于分析高脂饮食对兔肠道微生物组成与多样性的影响,支持微生物群落结构比较、差异菌群识别及饮食与宿主健康关系等研究(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
80日龄Hycole兔高脂饮食肠道菌群16S rRNA测序数据集
PRJNA1532633 是一个围绕 80 日龄 Hycole 兔在高脂饮食条件下肠道微生物 16S rRNA 特征分析而建立的 BioProject 数据集,源站标题为“ID 1532633 - BioProject - NCBI”,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集在本站被归类于“感染性疾病 / 其他”分类,主题标签为“Raw sequence reads”,即数据以原始序列读长形式提供。整体而言,该数据集可用于分析高脂饮食对兔肠道微生物组成与多样性的影响,支持微生物群落结构比较、差异菌群识别以及饮食与宿主健康关系等研究方向,为相关微生物组研究提供原始测序数据基础。
【数据集背景】
该数据集对应的 BioProject 记录来自 NCBI。BioProject 是围绕某一项单一研究计划而汇集的一组生物学数据,这些数据来源于单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集聚焦于 80 日龄 Hycole 兔在高脂饮食条件下的肠道微生物 16S rRNA 特征分析,属于肠道微生物组与饮食干预交叉的研究范畴。本站将其归入“感染性疾病 / 其他”分类,主题标签为“Raw sequence reads”,表明其数据形态以原始测序读长为主。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,说明其核心数据形式为原始序列读长。这些读长来自 16S rRNA 扩增测序,用于刻画 80 日龄 Hycole 兔在高脂饮食条件下的肠道微生物。依据源站描述,BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的多种数据类型,并提供链接以访问该项目产生的不同数据。就本数据集而言,其对外提供的数据以原始序列读长为主,可用于后续的微生物群落组成与多样性分析。关于样本数量、测序平台、读长长度、目标区域等具体技术参数,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“ID 1532633 - BioProject - NCBI”。其英文名称为“PRJNA1532633: 16S rRNA Profiling of Gut Microbiota in 80-Day-Old Hycole Rabbits Fed a High-Fat Diet”。从名称可知,研究对象为 80 日龄的 Hycole 兔,干预条件为高脂饮食,分析目标为肠道微生物的 16S rRNA 特征。BioProject 作为数据组织框架,来源于单一机构或联合体,并围绕单一研究计划汇集数据。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体机构名称等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于分析高脂饮食对兔肠道微生物组成与多样性的影响。具体而言,可用于微生物群落结构比较、差异菌群识别,以及饮食与宿主健康关系等研究。由于数据以原始序列读长形式提供,使用者可将其用于 16S rRNA 微生物组分析流程,包括序列质控、聚类或降噪、物种注释、多样性评估和差异丰度分析等通用环节。该数据集也可作为高脂饮食与肠道微生物相互作用研究的参考数据之一。关于其是否适用于其他动物模型、其他饮食条件或其他年龄段,源站未提供。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 记录查找该项目所链接的多种数据类型。由于该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,使用时应以原始序列读长作为分析起点,按照 16S rRNA 微生物组的标准分析流程进行处理。BioProject 记录提供统一入口,便于定位与该项目相关的数据资源。关于具体的下载方式、数据格式、文件组织方式、分析软件推荐等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集以原始序列读长形式提供,属于未经过高级加工的数据类型,其后续分析结果取决于所采用的处理流程与参数设置。本站分类为“感染性疾病 / 其他”,主题标签为“Raw sequence reads”。关于数据质量评分、测序深度、覆盖度、批次效应、阴性对照、重复数量等质量相关信息,源站未提供。使用者在解释结果时应注意,该数据集仅针对 80 日龄 Hycole 兔在高脂饮食条件下的肠道微生物 16S rRNA 特征,不宜直接外推至其他物种、其他年龄段或其他饮食条件。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录,源站标题为“ID 1532633 - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制、是否允许商业用途等,源站未提供。使用者应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关政策与条款,并在使用数据时参考源站记录获取最新信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1532633
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在表征接受高脂饮食处理的80日龄Hycole兔的肠道微生物群落。从喂食对照饮食或高脂饮食的兔中采集肠道内容物样本,并通过16S rRNA基因测序分析细菌群落。所生成的测序数据用于评估微生物多样性、群落结构以及不同饮食处理间细菌组成的差异。该数据集可能有助于更好地理解兔膳食脂肪摄入与肠道微生物群之间的关联。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




