PRJNA1531757：配对手部、智能手机与舌部样本的细菌和真菌扩增子测序
该 BioProject 收录了配对采集的手部、智能手机与舌部样本的细菌和真菌扩增子测序原始序列数据，主题标签为 Raw sequence reads
基本信息
资源简介
PRJNA1531757：配对手部、智能手机与舌部样本的细菌和真菌扩增子测序
PRJNA1531757 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物项目，其英文名称为“Bacterial and fungal amplicon sequencing of paired hand, smartphone, and tongue samples”。该项目围绕配对采集的手部、智能手机与舌部样本，开展细菌和真菌扩增子测序，所产生的数据以原始序列读段（Raw sequence reads）为主题标签。从项目名称与主题标签可以了解，该数据集的核心内容是与人体皮肤表面、个人电子设备表面以及口腔舌部微生物群落相关的测序原始数据。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在将同一项研究计划下产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找和访问。该数据集在分类上归属于感染性疾病 / 其他方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据集背景】
BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物学数据。按照源站描述，一个 BioProject 可以来自单一机构或联合体，其记录为用户提供了一个统一入口，用以发现该项目所产生的不同类型的数据。PRJNA1531757 正是这样一个 BioProject 记录，其研究关注点在于配对样本的微生物扩增子测序，涉及手部、智能手机和舌部三类样本。该项目的主题标签为 Raw sequence reads，表明其对外提供的主要数据形式是测序仪产出的原始序列读段。本站将其归入感染性疾病 / 其他分类，说明该数据集在应用层面可能与感染性疾病相关研究存在关联，但具体的研究假设、科学问题与结论，源站未提供。
【数据内容】
该数据集的内容为细菌和真菌扩增子测序数据，样本类型包括手部、智能手机和舌部，且这三类样本以配对方式采集。所谓配对采集，意味着同一研究对象可能同时提供了手部、智能手机和舌部样本，从而使得不同身体部位或物体表面之间的微生物群落比较成为可能。数据以原始序列读段的形式提供，主题标签明确标注为 Raw sequence reads。关于测序平台、扩增子靶标区域（如 16S rRNA 或 ITS 等具体标记）、读长、样本数量、数据量大小等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该 BioProject 的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据由 NCBI BioProject 数据库收录。项目英文名称中已说明样本来自配对的手部、智能手机与舌部。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、受试者人群特征、采集方法以及样本处理流程，源站未提供。该项目的组织来源、所属机构或联合体信息，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集可用于涉及人体手部、个人电子设备表面与口腔舌部微生物群落的扩增子测序分析场景。由于样本采用配对设计，适合开展不同采样部位之间细菌和真菌群落结构的比较研究。其原始序列读段形式也适合作为微生物组数据再分析的输入。该数据集被归入感染性疾病 / 其他分类，可能与感染性疾病相关研究存在应用关联。关于具体的适用分析流程、研究目标或已验证的应用案例，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录形式发布，用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该项目，并借助记录中的链接查找该项目产生的不同类型数据。数据主题标签为 Raw sequence reads，表明用户可获取原始测序读段用于后续分析。关于具体的下载方式、数据文件格式、是否提供预处理数据、分析工具推荐或操作步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 项目级记录，汇集了与手部、智能手机和舌部配对样本的细菌与真菌扩增子测序相关的原始序列读段。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、污染控制、阴性对照设置、批次效应以及数据完整性等信息，源站未提供。用户在使用时应自行评估数据质量与适用性。该项目的样本量、生物学重复情况以及统计效力，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，用户在使用时应遵循 NCBI 及 BioProject 数据库的相关使用条款与引用规范。关于该数据集的具体引用文献、作者列表、发表期刊、DOI、数据许可协议或使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1531757
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该BioProject包含来自一项横断面研究的双端Illumina MiSeq扩增子测序数据，研究对象为2026年在中国福建龙岩采集的人手、智能手机表面和舌部样本中的细菌和真菌群落。细菌文库使用引物341F和806R靶向16S rRNA基因V3-V4区。真菌文库使用引物ITS3和ITS4靶向ITS2区。数据集包含732个细菌和580个真菌原始测序样本。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
