鼻窦真菌球细菌失调配对16S rRNA基因测序研究

数据以 Raw sequence reads 形式提供,属于感染性疾病/其他分类。可用于研究鼻窦真菌球患者鼻腔微生物组的细菌群落组成与失调特征,支持微生物分类学分析、菌群差异比较及感染相关微生态研究(来源 NCBI)

sra
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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1529700: Bacterial dysbiosis in sinonasal fungal ball: a paired 16S rRNA gene sequencing study

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

鼻窦真菌球细菌失调配对16S rRNA基因测序研究

PRJNA1529700 是一个围绕鼻窦真菌球相关细菌失调问题而建立的配对 16S rRNA 基因测序研究项目,其源站标题为“human sinus metagenome (ID 1529700) - BioProject - NCBI”,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集在本站归入“感染性疾病 / 其他”分类,主题标签为“Raw sequence reads”,即以原始测序读长形式提供数据。整体来看,该数据集可用于研究鼻窦真菌球患者鼻腔微生物组的细菌群落组成与失调特征,支持微生物分类学分析、菌群差异比较及感染相关微生态研究。其核心价值在于以配对 16S rRNA 基因测序的方式,为探索鼻窦真菌球这一感染性疾病的局部微生态变化提供原始序列数据基础。

【数据集背景】

该数据集对应的项目名称为“Bacterial dysbiosis in sinonasal fungal ball: a paired 16S rRNA gene sequencing study”,中文可理解为鼻窦真菌球中的细菌失调:一项配对 16S rRNA 基因测序研究。鼻窦真菌球属于感染性疾病相关范畴,本站将其归入“感染性疾病 / 其他”分类。项目关注的核心问题是鼻窦真菌球背景下细菌群落的失调现象,并采用配对 16S rRNA 基因测序作为研究手段。源站描述指出,BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的生物数据集合,BioProject 记录为用户提供一个统一入口,以查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,说明其对外提供的主要数据形态是原始测序读长。

【数据内容】

该数据集以 Raw sequence reads 形式提供,属于感染性疾病 / 其他分类。依据其项目名称与侧写线索,数据可用于研究鼻窦真菌球患者鼻腔微生物组的细菌群落组成与失调特征,支持微生物分类学分析、菌群差异比较及感染相关微生态研究。数据来源为 NCBI。关于具体的样本数量、测序平台、读长长度、目标区域、配对设计细节、数据量大小、文件格式与文件数量等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“human sinus metagenome (ID 1529700) - BioProject - NCBI”。项目英文名称为“PRJNA1529700: Bacterial dysbiosis in sinonasal fungal ball: a paired 16S rRNA gene sequencing study”。从名称可知,研究对象与人类鼻窦微生物组相关,研究策略涉及配对 16S rRNA 基因测序。源站描述说明 BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的生物数据,并来自单一组织或联盟,为用户提供查找该项目多种数据类型的统一入口。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息、受试者人口学信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于感染性疾病 / 其他分类下的微生态研究,尤其是与鼻窦真菌球相关的细菌群落组成与失调特征研究。具体可支持微生物分类学分析、菌群差异比较以及感染相关微生态研究。由于数据以 Raw sequence reads 形式提供,使用方可基于原始测序读长开展后续的生物信息学处理与分析。关于是否适用于其他疾病、其他部位微生物组或临床诊断用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 Raw sequence reads 形式提供,可通过 NCBI BioProject 记录查找与该项目相关的数据链接。源站描述指出,BioProject 记录为用户提供单一入口,以查找该项目所产生的多种数据类型。关于具体的下载方式、分析流程、推荐软件、参数设置与参考数据库等信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,属于感染性疾病 / 其他分类。关于数据质量评分、测序深度、覆盖度、污染控制、批次效应、样本重复性、数据完整性及具体使用限制等信息,源站未提供。使用时应以 NCBI 源站记录为准,并注意该数据集为原始测序读长,后续分析结果依赖于所采用的处理流程与参考数据库。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“human sinus metagenome (ID 1529700) - BioProject - NCBI”,项目英文名称为“PRJNA1529700: Bacterial dysbiosis in sinonasal fungal ball: a paired 16S rRNA gene sequencing study”。关于具体的引用格式、许可协议、使用条款与数据共享政策等信息,源站未提供。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1529700

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究描述了29例鼻窦真菌球患者配对鼻窦标本的细菌群落特征。对患侧标本及配对的健侧标本进行了细菌16S rRNA基因V3-V4扩增子测序。该数据集支持细菌群落组成和多样性的配对比较。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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