PRJNA1522933：H1N1感染小鼠转录组分析
该数据集来自 NCBI，为 H1N1 感染小鼠的转录组原始序列读取数据，用于研究感染后基因表达谱变化，并评估中药提取物对转录变化的影响
基本信息
资源简介
PRJNA1522933：H1N1感染小鼠转录组分析
PRJNA1522933 是一个来自 NCBI 的转录组数据集，全称为“Transcriptomic Analysis of H1N1-Infected Mice”，即 H1N1 感染小鼠的转录组分析。该数据集属于感染性疾病领域的其他类目，主题标签为原始序列读取（Raw sequence reads）。其核心目的是通过转录组测序手段，考察小鼠在感染 H1N1 流感病毒后基因表达谱发生的变化，并进一步刻画一种中药提取物对这些转录变化的影响。研究者通过差异基因表达分析识别感染后表达上调或下调的基因，并评估中药提取物处理是否能使表达谱向正常对照组回归，从而为探索潜在分子机制提供数据基础。
【数据集背景】
该数据集围绕 H1N1 流感病毒感染小鼠模型展开。H1N1 感染会引起宿主基因表达谱的广泛改变，而该数据集的建立正是为了系统研究这些变化。除感染本身外，数据集还关注一种中药提取物的干预效果，试图从转录组层面观察该提取物对感染所致表达改变的作用。这一背景使数据集同时具有感染性疾病研究和传统药物作用机制探索的双重意义。
【数据内容】
数据集的内容为原始序列读取数据（Raw sequence reads），即转录组测序产生的原始读段。基于这些原始数据，源站描述中提及的分析包括：差异基因表达分析，用于识别 H1N1 感染后表达发生改变的基因并判断其表达升高或降低；对中药提取物处理后基因表达变化进行分析，评估处理是否使表达谱向正常对照组偏移；以及筛选在治疗组与正常对照组之间表达趋势相似、但与 H1N1 模型组相比表达水平显著不同的基因，用于富集分析以探索潜在分子机制。数据中具体包含的样本数量、测序平台、读段长度等信息源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），以 PRJNA1522933 为标识。其生物样本为 H1N1 感染小鼠，研究设计涉及感染组、中药提取物处理组与正常对照组的比较。关于小鼠品系、感染剂量、给药方案、采样时间点及组织类型等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于感染性疾病转录组研究的相关场景，包括：分析 H1N1 感染后宿主基因表达谱的变化；识别感染相关差异表达基因；评估中药提取物对感染诱导转录改变的干预效果；以及通过富集分析探索潜在分子机制。也可作为病毒感染的比较转录组研究或药物转录组效应研究的参考数据。
【使用方法】
使用该数据集时，可从原始序列读段出发，经过质控、比对和表达定量获得基因表达矩阵，再开展差异表达分析，比较感染组与正常对照组、治疗组与模型组之间的表达差异。随后可按照源站描述的思路，筛选治疗组与正常对照组表达趋势相似、但与模型组显著不同的基因，并进行富集分析。具体分析流程、参考基因组版本及参数设置源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为原始序列读取数据，使用前需自行完成质控与下游分析。关于数据质量指标、样本量、重复数、测序深度及潜在批次效应等信息，源站未提供。由于缺乏这些细节，使用者在解释分析结果时需谨慎，并应结合原始数据自行评估数据适用性。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，标识为 PRJNA1522933。关于引用方式、许可条款及使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1522933
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集旨在研究小鼠感染H1N1后基因表达谱的变化，并表征中药提取物对这些转录变化的影响。通过差异基因表达分析，识别H1N1感染后表达发生改变的基因，并确定其表达是升高还是降低。我们进一步分析了中药提取物治疗后基因表达的变化，评估治疗是否使表达谱向正常对照组观察到的模式转变。筛选出治疗组与正常对照组表达趋势相似、但与H1N1模型组表达水平存在显著差异的基因进行富集分析，以探究中药提取物抗H1N1作用的潜在分子机制。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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