养殖北极狐肠道细菌与病毒群落的鸟枪法宏基因组分析（与Cryptosporidium canis阳性相关）
该数据集来自NCBI BioProject，包含中国吉林和山东养殖北极狐（Vulpes lagopus）的19份粪便样本鸟枪法宏基因组测序数据
基本信息
资源简介
养殖北极狐肠道细菌与病毒群落的鸟枪法宏基因组分析（与Cryptosporidium canis阳性相关）
PRJNA1521038 是一项聚焦养殖北极狐肠道微生物组的鸟枪法宏基因组测序项目，研究对象为中国吉林和山东两地养殖的北极狐（Vulpes lagopus）。该项目围绕隐孢子虫（Cryptosporidium canis）感染状态，对19份粪便样本进行宏基因组测序，样本按寄生虫检出情况分为三组：仅隐孢子虫阳性、两种寄生虫均阴性、以及隐孢子虫与毕氏肠微孢子虫（Enterocytozoon bieneusi）双阳性。项目目标在于刻画肠道细菌与病毒群落的组成、功能谱以及感染相关模式，为理解寄生虫感染与肠道微生态之间的关系提供原始序列数据。数据来源于 NCBI BioProject，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads）。
【数据集背景】
隐孢子虫是重要的人兽共患肠道寄生虫，养殖场动物中的感染状况与肠道微生物群落之间的关系受到关注。北极狐作为毛皮动物在吉林、山东等地有规模化养殖，其肠道细菌与病毒群落的基线组成及与寄生虫感染状态的关联尚需系统数据支撑。本项目即在此背景下产生，通过鸟枪法宏基因组测序同时覆盖细菌和病毒群落，试图在群落组成、功能潜能和感染相关模式三个层面获得认识。项目名称明确指向“与 Cryptosporidium canis 阳性相关的肠道细菌与病毒群落”，说明其设计核心是比较不同感染状态个体的微生态差异。
【数据内容】
该 BioProject 包含19份粪便样本的鸟枪法宏基因组测序数据。按源站描述，样本构成如下：10份来自隐孢子虫阳性且毕氏肠微孢子虫阴性的狐狸，6份来自两种寄生虫均阴性的狐狸，3份来自两种寄生虫均阳性的狐狸。数据主题标签为原始测序读段，即未经过组装的测序输出。项目拟开展的分析方向包括细菌与病毒群落的组成刻画、功能谱分析以及感染相关模式的识别。除上述样本数量与分组信息外，测序平台、读段长度、数据量、组装结果等具体技术参数源站未提供。
【采集与来源】
样本采集自中国吉林和山东两地的养殖北极狐，样本类型为粪便。来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov，数据以 BioProject 形式组织，编号 PRJNA1521038。采样时间、采样季节、狐狸年龄与性别构成、养殖场数量、单场采样数、样本保存与运输条件等信息源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于肠道细菌与病毒群落的组成与差异分析，比较隐孢子虫阳性与阴性个体之间微生物群落结构的变化；可用于功能谱层面的探索，考察感染状态相关的代谢或功能潜能差异；也可作为养殖食肉动物肠道病毒组研究的参考数据。由于同时包含单阳性和双阳性样本，适合开展寄生虫共感染对肠道微生态影响的初步比较。此外，数据可服务于人兽共患寄生虫与宿主微生态互作的方法学探索。需要强调，上述用途属于领域内常见分析方向的表述，具体分析结论须以数据实际内容为准。
【使用方法】
使用时应先获取 BioProject 下的原始测序读段，按样本分组信息（仅隐孢子虫阳性10份、双阴性6份、双阳性3份）建立分析队列。常规流程包括读段质控与去宿主序列、细菌群落分类与丰度估计、病毒序列识别与注释、功能谱比对，以及组间差异比较。由于双阳性组仅3份样本，组间统计比较的把握度有限，分析设计时应予以考虑。具体的测序平台、建库方式与推荐分析参数源站未提供。
【质量与限制】
样本量总体为19份，其中双阳性组仅3份，组间样本量不均衡，可能影响差异分析的稳健性。数据为原始测序读段，未提供组装或注释结果。测序深度、读段质量、宿主序列比例、病毒检出灵敏度等质量指标源站未提供。采样仅覆盖吉林和山东两地养殖场，地理与群体代表性有限。此外，感染状态分组基于隐孢子虫与毕氏肠微孢子虫的检出情况，其他病原或混杂因素的信息源站未提供。
【引用与许可】
数据来源于 NCBI BioProject（编号 PRJNA1521038），使用时应遵循 NCBI 的相关数据使用与引用规范，并引用该 BioProject 对应的原始发表文献。具体的文献信息、作者列表、许可条款源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1521038
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该BioProject包含来自中国吉林和山东养殖北极狐（Vulpes lagopus）的19份粪便样本的鸟枪法宏基因组测序数据。数据集包括10份来自犬隐孢子虫（Cryptosporidium canis）阳性且毕氏肠微孢子虫（Enterocytozoon bieneusi）阴性的狐狸样本，6份来自两种寄生虫均为阴性的狐狸样本，以及3份来自两种寄生虫均为阳性的狐狸样本。该项目旨在表征肠道微生物组中的细菌和病毒群落组成、功能谱以及与感染相关的模式。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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