幽门螺杆菌感染对小鼠模型口腔与肠道菌群的影响
该数据集来自 NCBI，基于小鼠感染模型研究幽门螺杆菌感染对口腔-肠道微生物生态系统的影响。研究采集感染组与未感染组小鼠的唾液和粪便样本，进行 16S rRNA 基因测序，分析微生物多样性与群落组成，以评估与幽门螺杆菌感染相关的菌群变化
基本信息
资源简介
幽门螺杆菌感染对小鼠模型口腔与肠道菌群的影响
PRJNA1472968 数据集来自 NCBI，围绕小鼠感染模型开展，用于研究幽门螺杆菌感染对口腔-肠道微生物生态系统的影响。研究采集幽门螺杆菌感染组与未感染组小鼠的唾液和粪便样本，进行 16S rRNA 基因测序，并对微生物多样性与群落组成进行分析，以评估与幽门螺杆菌感染相关的菌群变化。该数据集属于感染性疾病 / 其他分类，主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），可为口腔-肠道轴微生物相互作用研究以及人类幽门螺杆菌感染中微生物生态变化的验证提供数据支持。
【数据集背景】
幽门螺杆菌感染是常见的感染性疾病问题，其影响不仅局限于胃部，还可能涉及口腔与肠道构成的微生物生态系统。该数据集正是基于这一背景，利用小鼠感染模型考察幽门螺杆菌感染对口腔-肠道微生物生态的影响。源站描述指出，该研究旨在支持口腔-肠道轴微生物相互作用的研究，并用于验证在人类幽门螺杆菌感染中观察到的微生物生态变化。因此，该数据集在感染性疾病与微生物生态研究的交叉方向上具有明确的背景定位。
【数据内容】
该数据集的主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），核心数据为对小鼠唾液和粪便样本进行 16S rRNA 基因测序所产生的序列数据。研究围绕微生物多样性与群落组成展开分析，以评估与幽门螺杆菌感染相关的菌群变化。样本覆盖感染组与未感染组小鼠，并同时涉及唾液与粪便两类样本，从而对应口腔与肠道两个生态位。除上述内容外，源站未提供更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。研究采用小鼠感染模型，采集幽门螺杆菌感染组与未感染组小鼠的唾液和粪便样本，并对其进行 16S rRNA 基因测序。样本类型、分组方式与测序策略均围绕评估幽门螺杆菌感染相关的微生物多样性与群落组成变化而设计。关于采样时间、样本数量、动物品系及具体测序平台等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于口腔-肠道轴微生物相互作用的研究，可用于考察幽门螺杆菌感染背景下口腔与肠道微生物生态系统的变化。同时，源站描述指出该数据集可用于验证在人类幽门螺杆菌感染中观察到的微生物生态变化，因此也适合作为相关人类研究结论的模型验证数据。此外，围绕微生物多样性与群落组成的分析需求，也可基于该数据集的 16S rRNA 基因测序数据展开。其他具体应用场景源站未提供。
【使用方法】
该数据集以原始序列读段的形式提供，使用时可围绕 16S rRNA 基因测序数据开展微生物多样性与群落组成分析，并比较幽门螺杆菌感染组与未感染组小鼠在唾液和粪便样本中的菌群差异。由于数据同时覆盖口腔与肠道样本，分析时可沿口腔-肠道轴对两个生态位进行比较。关于具体的分析流程、参数设置与软件工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于小鼠感染模型，源站描述提及其可用于验证人类幽门螺杆菌感染中观察到的微生物生态变化，但模型与人类实际情况之间可能存在差异，使用时应结合研究目的加以考虑。数据仅涉及唾液和粪便样本的 16S rRNA 基因测序，关于样本量、测序深度、质量控制指标及批次信息等，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJNA1472968: Effects of Helicobacter pylori Infection on the Oral and Gut Microbiota in a Mouse Model。关于引用方式与许可条款，源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1472968
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究采用小鼠感染模型，探讨幽门螺杆菌感染对口腔-肠道微生物生态系统的影响。收集幽门螺杆菌感染小鼠和未感染小鼠的唾液和粪便样本，并进行16S rRNA基因测序。通过分析微生物多样性和群落组成，评估与幽门螺杆菌感染相关的微生物群改变。该数据集旨在支持口腔-肠道轴上微生物相互作用的研究，并验证在人类幽门螺杆菌感染中观察到的微生物生态变化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
