幽门螺杆菌阳性患者舌苔菌群16S rRNA测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1456831

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探讨伏诺拉生-阿莫西林（VA）二联疗法，单用或联合半夏泻心汤（BXXXD），对幽门螺杆菌根除治疗期间舌苔微生物群的影响。我们收集了60例幽门螺杆菌阳性消化不良患者在三个时间点的舌苔样本：基线（W0）、治疗开始后两周（W2）和治疗后四周（W6，随访）。此外，还纳入了20例幽门螺杆菌阴性健康个体的样本作为对照。细菌16S rRNA基因的V3-V4高变区在Illumina Novaseq 6000平台上进行扩增和测序。该数据集能够表征与幽门螺杆菌感染、基于抗生素的根除治疗以及辅助草药干预相关的微生物多样性、群落组成和功能通路的变化。了解这些微生物群动态可能为减少抗生素诱导的菌群失调和改善幽门螺杆菌阳性消化不良患者的治疗结局提供策略依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。