PRJNA1439514：MRV感染人TMSCs转录组分析
该数据集包含来自三名供体的人扁桃体来源间充质干细胞（TMSCs）的RNA测序数据。每名供体的细胞在模拟处理对照和哺乳动物正呼肠孤病毒（MRV）感染两种条件下培养，共六个样本
基本信息
资源简介
PRJNA1439514：MRV感染人TMSCs转录组分析
PRJNA1439514 数据集收录的是针对哺乳动物正呼肠孤病毒（MRV）感染人扁桃体来源间充质干细胞（TMSCs）的转录组分析数据。该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，包含由三名供体的人扁桃体来源间充质干细胞产生的 RNA 测序数据。每名供体的细胞分别在模拟处理对照与 MRV 感染两种条件下培养，共形成六个样本。数据集旨在刻画 TMSCs 对 MRV 感染的转录响应，并支持在不同供体之间对感染样本与对照样本进行比较。其主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），在分类上归属于感染性疾病 / 其他。
【数据集背景】
该数据集围绕人扁桃体来源间充质干细胞（TMSCs）在哺乳动物正呼肠孤病毒（MRV）感染下的转录组变化而建立。研究设计采用同一供体来源细胞在两种条件下平行培养的策略，即模拟处理对照与 MRV 感染，从而在控制供体背景差异的前提下观察感染引起的转录响应。数据集的目标是表征 TMSCs 对 MRV 感染的转录反应，并支持感染组与对照组之间跨供体的比较分析。这一设计使数据可用于感染性疾病背景下宿主细胞转录组应答的研究。
【数据内容】
数据集包含 RNA 测序数据，样本来自三名供体的人扁桃体来源间充质干细胞。每名供体的细胞在模拟处理对照和 MRV 感染两种条件下培养，合计六个样本。数据主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），即数据集提供的是测序产生的原始读段数据。源站描述未提供各样本的具体读段数量、测序平台、读长、文件格式或数据体积等细节。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 条目 PRJNA1439514。生物样本为人扁桃体来源间充质干细胞（TMSCs），取自三名供体。实验处理包括模拟处理对照与哺乳动物正呼肠孤病毒（MRV）感染两种条件。每名供体在两种条件下各产生一个样本，共六个样本。源站未提供供体的具体人口学信息、细胞培养代数、感染复数、测序建库方法及测序仪器等细节。
【适用场景】
该数据集适用于研究 MRV 感染对人扁桃体来源间充质干细胞转录组的影响，可用于比较感染样本与模拟处理对照样本之间的基因表达差异，并可在三名供体之间进行跨供体的转录响应比较。其原始序列读段形式也适合作为转录组分析流程的输入数据，用于差异表达分析、感染应答通路探索等下游研究。由于数据涉及感染性疾病背景下的宿主细胞转录组，也可用于相关感染性疾病研究中的方法学参考。
【使用方法】
使用时可依据样本设计将六个样本划分为模拟处理对照与 MRV 感染两组，并按供体配对进行比较，以控制供体间差异。由于提供的是原始序列读段，通常需要先进行读段质量控制、比对或定量等转录组标准处理流程，再进行感染组与对照组之间的差异分析。源站未提供具体的分析流程、参考基因组版本或数据处理参数，使用时应结合研究目的自行确定分析方案。
【质量与限制】
数据集仅包含三名供体、每名供体两种条件共六个样本，样本量有限，跨供体比较时需考虑供体间变异。源站未提供测序深度、读段质量评分、重复实验信息及数据质控报告等质量相关细节。源站也未提供感染时间点、病毒株信息及细胞状态等实验条件细节，可能限制对结果的深入解读。此外，数据主题为原始序列读段，未提供经过处理的表达矩阵或分析结果。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用时应参考 NCBI BioProject 条目 PRJNA1439514 的原始页面获取相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1439514
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该BioProject包含来自三名供者的人扁桃体间充质干细胞（TMSCs）的RNA测序数据。对于每名供者，细胞在两种条件下培养：模拟处理的对照和哺乳动物正呼肠孤病毒（MRV）感染，共产生六个样本。该数据集旨在表征TMSCs对MRV感染的转录反应，并便于在不同供者间比较感染样本与对照样本。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
