衰老C57BL/6J小鼠肠道内容物16S rDNA测序数据集
该数据集来自NCBI，包含衰老C57BL/6J小鼠在鼠伤寒沙门氏菌诱导结肠炎后第7天采集的肠道内容物16S rDNA测序数据
基本信息
资源简介
衰老C57BL/6J小鼠肠道内容物16S rDNA测序数据集
该数据集来自NCBI，包含衰老C57BL/6J小鼠在鼠伤寒沙门氏菌诱导结肠炎后第7天采集的肠道内容物16S rDNA测序数据。对细菌16S rRNA基因V3-V4区进行扩增，并在Illumina NovaSeq 6000平台完成双端测序。数据可用于比较分析感染后肠道微生物群落结构与多样性，以及膳食酪蛋白水解物对老年宿主结肠炎恢复过程中产乳酸菌富集的影响（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本项目研究膳食酪蛋白水解物（CEH）对鼠伤寒沙门氏菌诱导结肠炎的衰老小鼠肠道菌群组成的影响。在感染后第7天从C57BL/6J小鼠采集肠道内容物，立即于-80摄氏度保存至DNA提取。使用商业粪便基因组DNA提取试剂盒（AU46111 96，BioTeke）从保存的肠道内容物中提取总微生物DNA。用通用引物341F/805R扩增细菌16S rRNA基因的V3-V4区，并在Illumina NovaSeq 6000平台（双端2 x 250 bp）上测序。该数据集可用于比较分析衰老宿主结肠炎恢复期间的微生物群落结构、多样性以及CEH诱导的产乳酸菌富集。
【主题与分类】
主题标签：Raw sequence reads。本站分类：感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1420017
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1420017
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目研究膳食酪蛋白水解物（CEH）对沙门氏菌鼠伤寒血清型诱导结肠炎的老年小鼠肠道菌群组成的影响。于感染后第7天采集C57BL/6J小鼠的肠道内容物，立即保存于-80℃直至DNA提取。使用商业化粪便基因组DNA提取试剂盒（AU46111 96，BioTeke）从保存的肠道内容物中提取总微生物DNA。采用通用引物341F/805R扩增细菌16S rRNA基因V3-V4区，并在Illumina NovaSeq 6000平台（双端2×250 bp）上进行测序。该数据集可用于比较分析老年宿主结肠炎恢复期间微生物群落结构、多样性及CEH诱导的产乳酸菌富集情况。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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